[求救] Non-coding RNA 查序列

[shinchenboy (欣承男孩)]

就是

我最近剛從NGS的data中找到一群我有興趣想觀察的non-coding RNA

由於有些目前還沒有人做過

所以在NCBI中搜尋不到序列

目前已知的資訊是那些ncRNA在Genome上的位置跟ID

想詢問說有什麼網站或軟體可以直接藉由上述兩樣資訊來尋找其cDNA的序列

以及gDNA的序列  如果能一起查到Exon及intron的資訊會更好喔

謝謝~









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※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1424925370.A.BC5.html
→ blence: 不是人的？ 是人的,有位置與ID應該有序列阿
推 mesenchymal: UCSC or ensembl
推 lelojack: 有在ensemble嗎？  可以從export data把設定區域的序列
推 lelojack: 可以從export data把設定區域的序列存成fastA
推 lingon: Just blat it or blast it first
→ Ice9: 推 UCSC。比 Ensemble 直觀多了。