[求救] 請問有辦法數攤開的細胞嗎？

[REIDO (NEET)]

目前實驗有些實驗需要數可見光的細胞，譬如單獨看貼附數量，或是BRDU這種的
，我們的細胞是MSC或是fibroblast這種會不規則的，不像DAPI染色這種
大小接近，又可以輕鬆濾掉背景的照片，請問有辦法透過半自動的方式去數嗎？

如果用滑鼠去人工數，真的很傷眼，而且數累了也會開始有誤差，增加人力數就
耗人力。我不指望能完全自動化，但就算要人力，也希望只是邊邊確認一下，或是
把連太近的分開這種。請問有人試過嗎？

--
                        小黃小黃別生氣，明天帶妳去看戲。


                        我坐椅子妳坐地，我吃雞腿妳啃骨。

--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.112.137.85
※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1449648806.A.CF3.html
推 yuasa: 把細胞核染了呢?這樣明顯很多
→ yuasa: 只能睡可見光阿?為什麼不能染色呢?
→ untilnow: 用imageJ做標記啊，他會自動幫你計數 你只要把細胞
→ untilnow: 都點到 檢查看有沒有沒上標的 數字他會幫你算
推 goshr: 我以前用過Aperio的軟體, 有一個功能是計算細胞核的數量
→ REIDO: 還是要自己點啊？一張照片就有上千顆的...好想自動化
推 fourhair: 有high content sys嗎？染CFSE再scan細胞後用軟體可以
→ fourhair: 算 不規則形狀也可以
→ Ice9: 用了 BrdU 方式，最後不就會有顏色？而如果是一般貼附，處在
→ Ice9: 分裂期圓化像漂浮的細胞算不算？apoptotic cells 算不算？想
→ Ice9: 來，半自動的話，大概也不會比你想像中的要省時許多。另外，
→ Ice9: 點細胞這種事情，如果有手寫板的話會比較好用。用滑鼠太刻苦
→ Ice9: 一兩盤還好，若是有幾萬個細胞要點，你還是來點音樂助興比較
→ Ice9: 呃，是「緩和情緒」比較好點。加油了。
推 jabari: 1.買有觸控螢幕的筆電 2.imageJ點
推 greenmoon00: 有自動數細胞colony的機器…不過要近百萬
推 greenmoon00: http://www.oxford-optronix.cn/product17/page501/m
→ greenmoon00: enu2/菌落计数/GelCount™/GelCount™.html
→ Ice9: GelCount是用來算colony的不是嗎？原po不是要算colony。
→ Ice9: 話說回來，這種機器比較適合大單位擁有，小實驗室負擔不起。