Re: [求救] 有人做microRNA的嗎？

[Fongshin (微笑曲線)]

我這陣子也有在接觸miRNA，不過真的不是很明瞭，因為實驗室的一部分計畫有接觸人體
試驗，當初是先收病患血液後，送去做
次世代定序（Next Generation Sequencing, NGS)，分析出來的data，再利用學校的IPA
生物路徑分享軟體生物資料庫，去做分析（這部分我只上了一堂教育訓練，還是聽不懂）
利用這軟體抓取相關的 基因序列（？）
Paper也會有寫序列調控哪些部分、相關
，因當初這部分不是我做的，所以沒法清楚的告訴你，很抱歉
一般會使用的網路資源還有 miRBase
(http://www.mirbase.org/) 裡面會有你需要的序列，也會有相關性，不過聽業務說裡面
大多為human和mouse，另外，ABI 自己後來有一個TagMan的資料庫，裡面還包含rat可用
的部分
由於我們實驗室也是才開始做這些部分，所以抽取miRNA都是使用Qiagen 的試劑（以前是
諾貝爾公司獨家代理，現在原廠自己開立公司為凱杰）我現在使用上有問題會跟他們請教
，當然也有很多公司可以問，只是剛開始還是會想問大廠的，不過Qiagen試劑不便宜，mi
RNA用的也沒有大包裝可以買，剛開始可以先試看看，不過之後可以試著用小廠自己去合
成需要的primer序列，除非你們實驗室很有錢.........
進階、凱杰、ABI(應該是併在萊富 invitrogen)
生工、基龍米克斯...等都可以問看看，最近跟我們有接觸的還有研毅公司

另外那個NGS的部分，之前實驗室接洽的是 威健生技公司，你都可以打電話詢問看看

我只有這一點點小資訊，希望可以幫到你的忙


※ 引述《whatupmen (jia)》之銘言：
: 最近教授與醫院合作
: 開始接觸miRNA
: 只是有個問題
: paper裡的miRNAxxx
: 是如何找到？
: 還是用已知序列去設計
: 然後亂槍打鳥這樣？
: 還是有一套的sop  ？
: 請做過miRNA大大 指點迷津一下

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→ Fongshin: 欸，寫了一大堆才發現我不是回作者信箱啊...
※ 編輯: Fongshin (59.115.135.156), 01/07/2016 21:20:35
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→ Fongshin: 有收到創世紀公司業務的來信，感謝他提供的資訊，貴公司
→ Fongshin: 也有相關資訊和產品可以試用和詢問，自己實驗室不是很
→ Fongshin: 有錢，所以也只是先求不出錯和穩定，之後也會試著使用
→ Fongshin: 其他品牌的試劑做看看，感謝資訊分享～
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