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抱歉!第一次在本版上發問有踩到雷,或有人問過先說聲抱歉因為沒搜到... 問題 http://i.imgur.com/cGvw23L.jpg 用0.5X TBE 2% agarose 100V直接跑含有限制酶截切過的PCR產物(沒純化.酵素還在裡面) 結果發現看起來在primer dimers的地方好像都會有不明壓力把band擠歪,詳細如下: (DNA+2X Ampliquin Mix Red+Primers+水的產物直接用限制酶+對應Buffer,作用 完後直接跑0.5X TBE 2%agarose 100V膠30min) 在確定不是膠沒做好的前提下,發現不管跑幾次都會像圖片這樣歪斜把ladder跟產物擠掉 像是以前跑的也會有同樣情形 http://i.imgur.com/F26LP3J.jpg 應該也不是TBE容液沒配好,請問有解嗎? 不知道有沒有漏講什麼隨時補充~感謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.112.60.5 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1466746661.A.920.html
blence: TBE不用1X卻用2X的理由是? 06/24 14:35
leoblack: 歪斜通常是因為RE buf的鹽影響,純化過會改善 06/24 14:40
eric0120000: 感謝!2X 說錯是0.5xTBE、膠是2% 06/24 15:07
Ianthegood: 你真的用2x tbe跑就不會被re的鹽影響了 06/24 15:12
所以如果我提升TBE跑膠的倍數理論上鹽類影響band歪斜可以獲得改囉?我來試試
yesno1011: 可以在產物裡面加限制酶用的Buffer調整鹽度 06/24 16:22
感謝!好~我來對看看原產物裡面到底含有哪些鹽類可以透過Re buffer來調整濃度~ ※ 編輯: eric0120000 (140.112.60.5), 06/24/2016 16:34:24
yesno1011: 講錯了QQ 是在沒限制酶Buffer的部分加 (如Ladder 06/24 18:17
yesno1011: 反正就是把所有泳道的鹽度調到差不多就可以了 06/24 18:17
eric0120000: 好唷!感謝大大們的幫忙 06/24 19:51
xxtomnyxx: 該不會是 NEBuffer 吧 XD 06/24 20:07
xxtomnyxx: 如果只是切 RE 確定 DNA 是正確的而不是要做 gelextrat 06/24 20:08
xxtomnyxx: ion 的話,我都用總體積 5 uL 去切,之後用水稀釋到 15 06/24 20:09
xxtomnyxx: uL 才拿去跑膠,這樣也是能改善。 06/24 20:09
eric0120000: 有NEB也有CutSmart!感謝提供這方法我會試試看! 06/25 00:02