作者hachibuya (黃金騎士 牙狼)
看板Biotech
標題[方法]請教計算colocolization的方法?
時間Sun Jun 26 01:27:18 2016
用螢光顯微鏡染了幾種蛋白質
想要兩兩比較其colocolization的多寡
上網下載了image J的coloc 2 plugin
也讀了該網頁上的教學
http://imagej.net/Colocalization_Analysis
http://imagej.net/Coloc_2#How_to_use_Coloc_2
跑出來的結果會有以下這幾種
Pearson's correlation coefficient
Manders split coefficients
Spearman's rank correlation value
Kendall's Tau-b rank correlation value
搞了半天也不知道如果要拿來寫paper的話選哪一種結果來比比較好
查了一些paper也查不到有詳細寫分析方法的
專門在講colocolization的paper又寫得好難
不知道有沒有人有研究過這方面的能給小弟一些指教
感激不盡
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→ Ianthegood: 星星最多的那個啊 06/26 04:08
推 goodday06: 我都找paper 就完全學paper的方法 06/27 19:14
→ goodday06: 當然要看paper等級 有得寫得非常簡略 我就學他簡略XD 06/27 19:15
推 tynse71864: 一般用前兩個吧 有些 paper兩種結果都會同時秀出來 07/04 21:19