各位前輩大家好
最近在做論文研究，研究的資料是Whole genome sequencing，
資料大概像是以下這樣
          snp10001 snp10002 snp10003 snp10004 snp10005 snp10006
[1,]        2        2        0        0        2        0

[2,]        2        1        0        0        1        0

[3,]        2        2        0        0        2        0

[4,]        1        2        0        0        2        0

[5,]        2        1        0        0        2        0

[6,]        2        2        0        0        2        0

gene資料形式是以copy number呈現，
想請問各位大大，分析的軟體是R software，
為什麼在很多packages裡MAF的計算，是colMeans(genodata)/2 來計算MAF?
也就是對每一個column做平均在除二，google找不到相關解釋，謝謝各位大能大神!

--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 49.216.148.73
※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1475508287.A.B40.html
※ 編輯: x9060000456 (49.216.148.73), 10/03/2016 23:26:27
推 lingon: what's your row?