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各位大大好,小弟最近進行大腸桿菌表達蛋白時出現了一個問題 實驗流程是這樣 沾取少量的菌加入10mL含有抗生素的LB 搖晃培養16小時後加入1L含有抗生素的LB 搖晃培養直到O.D值0.5~0.6之後加入1mM IPTG 表達4小時之後10000g離心收取菌 現在的問題在於: 離心收下來的菌異常的少,進而導致後續的純化結果很差 但是實驗流程明明有用UV測600nm波長的O.D值達到0.5~0.6之間 照理來說菌量應該取決於O.D值? 所以只要沒測錯就應該有正常的菌量才對 奇怪的是以前沒有這個問題,是自從改成1L的LB加入抗生素之後發現有這個狀況(以前沒加) 此外UV測量器是公用器材,似乎設定有被動過 小弟想知道的是 1.加入IPTG之後細菌是否會繼續生長 2.在大瓶1L的LB culture這邊加入抗生素是否影響後續細菌的生長 3.UV儀器小弟不熟,有設定能夠讓測的O.D值變得跟原先不同? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.128.123.73 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1489723611.A.5DC.html
milkpa: 請先知道何謂正常。另,加入IPTG誘導外源基因表現一般來說 03/17 12:40
milkpa: 都會抑制host生長,所以前幾次都會做一管平行實驗,不加 03/17 12:41
milkpa: IPTG的看生長曲線做比較 03/17 12:42
a90648: 開到UV燈泡而不是可見光燈泡? 03/17 13:32
Ianthegood: induce後還會不會長因素極多 host strain, vector, pr 03/17 18:20
Ianthegood: otein size, toxicity等 03/17 18:20
Ianthegood: "uv儀器"是全世界都長一樣膩 03/17 18:21
Ianthegood: 有可能是你的protein很毒 express的時候死光了 induce 03/17 18:22
Ianthegood: 完再測吸光值看看 03/17 18:22
抱歉小弟儀器沒有講清楚,這次主要在於與先前成功實驗的比較,所以不確定所謂正常的菌量該如何 我們實驗室比較偏化學,這部分的實驗沒有在看生長曲線,都是直接試,跑膠看哪個條件好 然後小弟有比較IPTG對細菌生長的影響,沒加IPTG細菌的OD值會比有加的高,表示有加的長比較不好? 小弟可能會再搖一個大量LB culture,來比較有無抗生素的影響
blence: 從文章看起來就是只有抗生素與"UV儀器"是跟以前不一樣吧 03/18 03:27
blence: 既然如此,這次突然加抗生素的理由是? 03/18 03:28
老闆一直認為之前實驗條件得到的蛋白不夠濃不夠純,一直想改條件 討論後老闆認為大LB culture應該要加才對,先前的實驗是錯的,理由如qumai大所說 其實蠻合理的,但是菌真的變很少,所以現在要釐清到底是本來菌就不該長那麼多還是別的問題
tynse71864: 測的 OD值對嗎@@ 03/18 22:37
有找其他比較熟練的人去研究儀器,測量步驟沒錯,只是好像沒有甚麼標準品可以檢查儀器本身是否正常
qumai: 以前沒加抗生素可能plasmid都被踢掉了,菌不用做蛋白長得快 03/19 13:21
要做蛋白,大大說得很合理,也許其實本來就不該有這麼多菌? 小弟準備要純化長較少的菌跑膠看看 也許會比之前沒抗生素長較多菌的時候結果還要好
s992003: 為啥都會一直repeat Orz 03/20 12:20
blence: 不濃,跟蛋白特性大小有關,要試的應該是誘導溫度,時間,IPTG 03/20 13:00
blence: 等;不純,這一開始沒問,也不知有沒兩端tag純化或切膠處理 03/20 13:02
blence: 而抗生素,反正養菌就該加,不用試有無的差異了 03/20 13:02
blence: 另外,從10ml放大到1L續做4小時誘導再離心收菌,以早九晚五 03/20 13:06
blence: 的工作時間,OD是有可能被高估,但這只是推測 03/20 13:07
誘導條件之前有抓過,應該還可以 抱歉我一直把問題放在菌量異常,沒有提到後面的實驗問題,我們是用his-tag搭配NTA beads純化 另外我們是先把10mL放到1L放大,測OD是測1L那瓶的OD值,10mL的就是養16小時沒有測OD
Ice9: 一開始放到1L,是算OD值多少開始?養到OD 0.5–0.6 要多久? 03/20 13:44
Ice9: 對了,你10ml菌是養在什麼容器內? 03/20 13:48
10mL養在細長圓底瓶,沒有量OD,丟入1L裡面養到0.5-0.6大約3小時 ※ 編輯: s992003 (140.128.123.73), 03/22/2017 11:45:05
star55555: 其實加抗生素菌體本來就會長得較差,而菌量少跟純化效 03/26 11:29
star55555: 果不好似乎沒有關係 03/26 11:29