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哈囉各位大大 小弟在做重組蛋白的表達 最近因為業務的推薦 把表達的菌株從原先的BL21換成C43(DE3) plyss 第一步送vector到菌裡面塗盤沒問題 第二步要從盤上篩選較強的菌這邊有些疑問 學長姐傳下來的做法是挑幾個較大的菌株 都把他們搖16小時然後破菌 不用離心分掉膜跟細胞質 直接western看表現量 選Band深的就對了 請問這樣的做法是正確的嗎? 上網查有聽說要測什麼copy number但不知道要怎麼測量 另外想問要怎麼確認我的蛋白產生inclusion body 這個蛋白是周邊膜蛋白,但paper推測的穿膜區域已經把他切掉了 之前用BL21表達 測試好幾種detergent 還有不同濃度的條件 都沒辦法溶出很多蛋白 也沒有能做活性測試的材料 所以不知道有沒有產生inclusion body -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 117.19.146.85 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1493633464.A.76B.html
mosu0714: copy number從你用的plasmid去追查就知道了吧 05/01 20:40
原來copy number完全是跟基因有關 跟後面的事情無關!? 會不會我這個蛋白試了各種條件都沒起色就是因為用了濫vector QQ
milkpa: TM拿掉應該就是有機會soluble了吧,為啥還用C43? 05/01 21:00
我們本來都這樣子想,但跑膠結果看起來還是一堆卡在膜上的樣子,不知道如何是好 ※ 編輯: s992003 (123.205.17.239), 05/01/2017 21:46:07
Ianthegood: copy number跟plasmid的ori有關 05/02 01:07
Ianthegood: 你要做活性還要收inclusion body? refolding比擲杯還 05/02 01:08
Ianthegood: 難啊 05/02 01:08
icheee: 聽起來是本來想要透過測活性來看有沒有 inclusion body 05/02 05:35
icheee: 但是沒有測活性的 assay 所以想要用其他方式判斷是否產生 05/02 05:36
icheee: inclusion body? 05/02 05:36
我不想要inclusion body,但是不知道有沒有發生inclusion body i大沒錯,我的想法是聽說inclusion body的蛋白通常不會具有活性,想看活性來判斷 現在跑膠來看感覺蛋白卡死在膜上,用detergent溶出的效果極差,但不確定是否產生inclusion body 我以為C43 plyss會有比較好的結果,比BL21貴兩倍說QQ ※ 編輯: s992003 (140.128.123.73), 05/02/2017 09:09:23
icheee: 測表達條件我會離心分 supernatant 跟 pellet 然後跑膠看 05/02 13:44
icheee: 看 induction 有沒有成功 並看是不是 soluble 05/02 13:46
icheee: (不過很久沒表達/純化蛋白了,有錯請大家指正>< ) 05/02 13:47
Ianthegood: 如果有閒錢的話 買一點bugbuster 看soluble/ib非常方 05/02 20:18
Ianthegood: 便 而且small scale可以用很久 05/02 20:18