[求救] 請教MaxQuant裡的參數設定

[champ12 (champion)]

大家好

我將sample送到中研院打Mass spec
使用的機台為Orbitrap velos

拿到sample後我使用MaxQuant進行protein ID
之後會再用Skyline進行定量
目前遇到的問題是在Instrument的參數設定上
雖然MaxQuant對Orbitrap系列的機台已經有預設的設定
但對於每個參數的意義實在一知半解
懇求非常了解ms/ms的大大為我解答

這是參數頁面的截圖
http://i.imgur.com/O4ikPSi.jpg

真的萬分感謝QQQQ 救救想畢業的女子QQ

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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 223.140.52.7
※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1495680250.A.8D9.html
推 biingru: 我也不懂這個機器
→ biingru: 但是我遇到這個問題我會先google他的操作手冊來看
→ biingru: 訓練自己獨立解決問題
你好，因為這個軟體的網頁幾乎沒有敘述，在找過數篇與這個軟體相關的paper後 (也看
了youtube與一些國外上課的講義) 還是沒辦法解決這些參數的設置，所以才決定上來請
教大家><
※ 編輯: champ12 (223.140.52.7), 05/25/2017 11:03:11
推 lelojack: 機器沒有敘述代表這是專有名詞，請去找定義;  如果連定
→ lelojack: 義都不清楚，代表你的背景不足，就我的經驗是一般是缺
→ lelojack: 數學及統計的基礎
推 Ianthegood: 我不太懂的是 假設你是自己做wet lab  你只是要protei
→ Ianthegood: n id 幹嘛需要這些參數? 明明論文裡一句中研院質譜服
→ Ianthegood: 務結果就可以解決XD
推 lelojack: 許多文章都指向這個文件 https://goo.gl/6FWNZg 請參考
→ july81212: MPI summer camp youtube有檔先看完吧……
推 grazzilybear: 你需要瞭解什麼可以站內信問我，會的我儘量解答。針
→ grazzilybear: 對定量MQ已經可以提供好的定量結果不需要再使用skyl
→ grazzilybear: ine