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小魯又來了,謝謝先前大大們的意見 之前一直在嘗試用e.coli表達純化 後來發現不論怎麼用 蛋白幾乎全部都卡在固體中 老闆認為應該是inclusion body 改用低溫表達結果幫助不大 最後決定純化inclusion body的蛋白 參考paper的方式用輕微變性的方式溶解固體 首先用含有lysozyme、PMSF的buffer收菌pellet 利用冷凍解凍再sonication破菌 10000g離心後再分別用1%、2%triton洗掉脂質膜 接著用1M NaCL清洗、再用DDW 清洗 這個時候的pellet其實沒什麼變化,感覺沒有洗掉inclusion body以外的東西 但還是繼續做 用2M urea pH 12.5的 buffer搖晃8小時 溶解固體 16000g 離心30分鐘,這時候的固體變很少了,已經溶解大部分 (這部分跑膠過了,有蠻多我的目標蛋白,還算乾淨,背景沒有很多雜band) 取上清液與NTA-beads binding 2小時 後面就用10、20mM 的imidazole清洗 然後用250mM imidazole elute 發現好像beads上吸的蛋白沒有很多 可是照吸附原理來看 應該是pH越高 histag越容易吸上beads 但結果看起來不像 Beads說明書是說pH大於12的話binding不要超過2小時,怕beads被破壞之類的? 另外除了binding不好之外 Elute的效率也沒有很好 還是說250mM的濃度其實不夠 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 175.96.97.50 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1496827063.A.1AC.html
VVade: 這哪個實驗室設計的實驗... 06/07 17:42
s992003: 我們在清洗inclusion body比較粗糙 因為藥品都還沒來 但2 06/07 20:07
s992003: M urea pH12.5是paper 的條件 06/07 20:07
Ianthegood: ib裡面應該不會有太多你的蛋白以外的東西 你就收ib就 06/07 21:29
Ianthegood: 好 不用再過column了啦 06/07 21:29
好的我們後來發現真的不需要過column了,ib洗乾淨的話真的都是我們要的蛋白
huangsw: 要看你的蛋白用途阿, 另外pH太高, 很多resin撐不久 06/07 23:44
我們希望蛋白仍保有活性,後來有paper說ib不見得一定是無序糾結,我們才嘗試走這條路
joseph103331: Binding不好是怎麼看的? Wash有一起檢查嗎? 06/08 14:56
跑膠看binding前後的上清液 發現目標蛋白看起來沒減少,但beads理論上的吸附容量蠻大的 感覺binding後的液體目標蛋白應該要明顯減少? ※ 編輯: s992003 (140.128.123.73), 06/13/2017 17:11:29
bloodgas: IB裡的蛋白已經很純了不用再nickle純化了,主要是復性 07/07 12:29
bloodgas: 之後有沒有正確摺疊 07/07 12:29