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小弟剛踏入dry lab沒多久, 老師在和我聊過後認為我需要優先培養dry lab相關的sense, 目前小弟的計畫是關於建立與整合mutation sequence database, 並進行annotation相關的工作。 在這裡想請教各位熟悉大數據相關annotation的前輩, 想要尋找能夠一次進行數千筆甚至數萬筆以上sequence的annotation相關的軟體, 要從什麼方向或關鍵字切入尋找(以提供在linux上進行的open source為主)? 目前從PubMed一些review paper看到的資料大都像blast系統一樣, 一次只能input幾個sequence。 謝謝~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 163.25.93.81 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1500282425.A.1B4.html keroromoa:轉錄至看板 BioMedInfo 07/17 17:13
lelojack: 請問什麼物種呢????人的就蠻無聊工具都寫好好的 07/17 18:36
lelojack: 你可以參考這個網站 這幫我不少https://molbiol-tools.c 07/17 18:43
lelojack: a/Genomics.htm 07/17 18:43
Ianthegood: blast2go? 07/17 19:50