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請問各位,小弟收取10^7的陰道鞭毛蟲,使用lysis buffer(4%CHAPS,8M urea)後,離心 取上清液測蛋白濃度有30mg/ml,之前以4倍稀釋劑跑膠,染完commasie blue 後,得出的 結果竟是如圖一樣,完全沒有banding,而是smear一條一條,這樣是正常的嗎? http://i.imgur.com/Q5mxKYR.jpg -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 101.10.99.9 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1501169664.A.53B.html
xy234786: 正常來說總蛋白lysate去跑應該要有一條條各種大小蛋白 07/27 23:37
xy234786: 的band吧? 我這樣是因為沒有破細胞破完全嗎? 07/27 23:37
Ianthegood: 可以錯的地方很多 細胞 lysis page coomassie 07/28 02:38
Ianthegood: 每一步都要有control 07/28 02:39
xy234786: 細胞指的是太少嗎? lysis buffer我是照著學長給的配 07/28 09:01
xy234786: 需要sonicator打破嗎? 膠的部份應該沒有問題 正常的配 07/28 09:01
xy234786: 12%膠 染色我染10分鐘後就多換幾次清水... 07/28 09:01
Ianthegood: "control" 07/28 17:57
Ianthegood: 旁邊跑一個新鮮的bsa就知道問題在哪一端 07/28 17:58
xy234786: http://i.imgur.com/QaVF5sM.jpg 07/29 10:58
xy234786: 我用我之前的純化蛋白跑在旁邊,這樣代表什麼呢 07/29 10:59
jsi: 看起來膠跟染劑沒問題,靠近marker的sample隱約有淡淡的band 07/29 14:39
jsi: 可能是蛋白質量少(細胞破裂程度不夠,或細胞數量太少),不過 07/29 14:41
jsi: 有時候在WB,經由抗體抗原結合+放大效應,會有比較明顯的band 07/29 14:42
jsi: 可考慮用濃度較高的sample跑膠,若lysis buffer不會干擾跑膠 07/29 14:45
jsi: 甚至可以不要加稀釋液 07/29 14:46
xy234786: 如果是破細胞破不完全,會測的到30mg/ml這樣的濃度嗎? 07/29 19:31
xy234786: 那如果這樣是不是要用sonicator再破會畢較好 07/29 19:31
jsi: 我不了解陰道鞭毛蟲特性,無法判斷您lyse cell過程是否足夠, 07/29 22:38
jsi: 加入lysis buffer後sonicate或其他增加蛋白質暴露的方法都值 07/29 22:40
jsi: 得一試,要注意溫度或其他條件,避免蛋白質遭受破壞。您用 07/29 22:41
jsi: urea,需先確認是否會干擾蛋白質濃度測定試劑,是否有偽陽性 07/29 22:44
jsi: 的問題存在? 07/29 22:44
xy234786: 我是使用nanodrop測定,並以lysis buffer做為blank 07/30 10:30
xy234786: 會不會是有可能蛋白都degrade了,斷了,但仍然測的到高 07/30 10:31
xy234786: 濃度 07/30 10:31
joseph103331: 吸光值不太準 用Bradford定量看看 07/30 10:46
xy234786: 我也使用braford試過了 確實有這樣的濃度 07/30 13:43
xy234786: 我使用sonicatorhttp://i.imgur.com/Rya8ioU.jpg後的跑 08/02 14:29
xy234786: 膠結果 08/02 14:29
xy234786: 這樣算正常嗎? 08/02 14:29
Ianthegood: 比較好一點囉 看來是本來你的蟲的expression就比較平 08/02 16:23
Ianthegood: 淡一點沒什麼特別高的gene? 08/02 16:23