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各位先進好 小弟日前在做DNA 電泳時 發現GAPDH的band歪歪的形狀也很奇怪 https://i.imgur.com/zq5ibi1.jpg 因為當天是跑同濃度的兩片膠 都是2% 100V 跑25分鐘左右 配膠和電泳槽都是用的是新的TBE 第一片跑的目標基因band是正常的 於是懷疑是前一片膠剛跑完buffer溫度太高 隔天同一批sample單獨再跑一次GAPDH 這次改為50V 跑的時間拉長 跑出來的band還是歪歪的形狀也不太正常 https://i.imgur.com/g1X2zPZ.jpg 想問各位大大有遇過類似情形 或是有什麼條件我可以再改正嗎 感謝! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 203.71.94.31 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1510284747.A.0DE.html
xxtomnyxx: 看起來是 gel 的 buffer 和電泳槽的 buffer 的不一樣,11/10 11:48
xxtomnyxx: 還有每個 sample 的 buffer 似乎也不同造成的11/10 11:49
xxtomnyxx: Gel 的部分可能是配製時蒸發的水沒補或補太多,或者是11/10 11:50
xxtomnyxx: 或者是電泳槽的 buffer 放太久蒸發太多水。11/10 11:50
謝謝大大~但都是用同一罐buffer唷!
blence: 推測,你PCR取target跟GAPDH相同cycle放大、相同體積跑膠11/10 12:27
blence: 當你覺得target正常,這時GAPDH的產物太多,膠圖肯定不好看11/10 12:28
blence: marker其實沒歪,再加上marker這麼弱,所以懷疑是上面因素11/10 12:29
好的,很認同大大的看法,會嘗試從這邊下手
july81212: tracking 都歪掉了 應該換buffer 電泳槽順便洗一下吧11/10 14:28
july81212: 然後有tailing 可以load少點會好些11/10 14:30
是很久沒洗了哈哈來洗一下,減少loading 的量ok!
aeroufo: 膠的厚薄不一嗎?11/10 16:12
厚薄我覺得是一樣 都用用50ml做的 不知道是不是太厚 ※ 編輯: blueberrytv (203.71.94.31), 11/10/2017 17:34:44
Ianthegood: 你用TBS跑agarose??11/10 18:23
aj1139: 問題同樓上,正常不是TAE或TBE嗎?11/10 21:42
講錯了 是TBE 已修!
ernielwl: buffer換TAE吧,然後laoding的量減半,整條跑道都爆了11/11 17:15
ernielwl: 然後制膠時候一定要確定煮滾並且均勻11/11 17:17
好!感謝大大建議~ ※ 編輯: blueberrytv (203.71.94.31), 11/13/2017 09:27:43