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最近實驗進行到將克隆在pGL3 basic裡的DNA片段用Luciferase測試表現程度。 目前測試條件為:24孔板,每孔400ng DNA,1ul Lipo2000,有使用pGL4.74為對照,每孔濃度0.1ng, 在60%細胞滿盤時轉染,中間不換液,等待36小時裂解後讀盤。 (我做的事之前實驗室助理教我的,但是我有在網上查到轉染時建議用沒有血清也沒有抗生素的培養液, 而且六小時後換含血清不含抗生素的培養液,不知道是否適合我的情況?) 老師希望我使用Lipofectamine 2000轉染這些Plasmid到Fibroblasts,實驗結果,最高的數字大約是六百多。 但數據老師不太滿意,告訴我"the efficiency is not enough"。 想請問大家,如何的efficiency才是達到標準... 不知道這是不是一個很基礎的問題,但因為是半路轉行所以有一些基礎知識不懂,查了文獻之後心中仍然感到疑惑沒有找到答案, 希望有經驗的大大能幫忙回答或是指點一下方向,感謝 -- Sent from my Windows -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 198.184.147.19 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1515538693.A.173.html
turtle24: 600多是對照組的值嗎? 01/10 07:06
turtle24: 有很多地方需要檢驗,像是質體的品質,細胞本身好不好 01/10 07:08
turtle24: 轉殖 01/10 07:08
turtle24: 如果材料跟步驟都是前人留下的又沒人能討論會比較難找 01/10 07:09
turtle24: 原因 01/10 07:09
turtle24: 抱歉因為網路問題好像多送出一段推文 01/10 07:10
belle0625070: 600~1000左右是實驗組的值,對照renilla大約是100出 01/10 07:13
belle0625070: 頭 01/10 07:13
belle0625070: 老師有說過這種細胞轉染效率本來就不好,但是我很疑 01/10 07:15
belle0625070: 惑的是,那怎麼樣的數據才是能夠接受的 01/10 07:15
milkpa: 用相對值,不要用絕對值 01/10 08:35
xxtomnyxx: Renilla 太低了,這樣很危險。 01/10 14:02
xxtomnyxx: 你測測看一組只放 ffLuc 和一組只放 rLuc 去測,你 01/10 14:04
xxtomnyxx: Renilla 讀值 100 出頭以 Luciferase assay 來說太接近 01/10 14:04
xxtomnyxx: background 了。然後如果是質疑你 transfection 效率, 01/10 14:05
xxtomnyxx: 你就做一次 transfect 表現 EGFP 的 vector,看有 EGFP 01/10 14:06
xxtomnyxx: 表現的細胞有多少,在和前人或網路上同細胞株的實驗對 01/10 14:07
xxtomnyxx: 照,就可以知道是你轉染不好還是該段 DNA 本身的 01/10 14:07
xxtomnyxx: transcriptional activity 很差了。 01/10 14:07
xxtomnyxx: 另外,用無血清培養基 transfection 的問題,我個人用 01/10 14:09
xxtomnyxx: lipo2000 和 lipo3000 都做過測試,至少在我用的細胞株 01/10 14:09
xxtomnyxx: 上幾乎沒有影響,不過這可能取決於培養基種類和細胞種 01/10 14:10
xxtomnyxx: 類,比起問人得到含糊不清的答案,自己測試看看才是最 01/10 14:11
xxtomnyxx: 有效的解決辦法 01/10 14:11
joseph103331: 我們是至少混DNA時要無血清,有些資訊甚至會連抗生 01/10 16:40
joseph103331: 素都不建議添加,真的要試過才會知道。總之先分析 01/10 16:40
joseph103331: 一下做相同細胞的paper選用的條件,然後再用GFP測 01/10 16:40
joseph103331: 試轉染效率,最好連liposome跟DNA的比例都titrate 01/10 16:40
joseph103331: 一下比較好,不同細胞在做luc的時候讀值也不同,我 01/10 16:40
joseph103331: 們老師至少要求到千位,然後相對量比絕對量重要, 01/10 16:40
joseph103331: 給你參考一下。 01/10 16:40
blence: "600~1000左右是實驗組的值,對照renilla大約是100出頭" 01/10 20:25
blence: 原po推文這句話,不像是co-transfect操作的描述方式 01/10 20:25
blence: 也不知道100是指純pGL4.74的值,還是pGL3/pGL4.74的相對值 01/10 20:25
belle0625070: 補充說明一下,我每孔是加0.1ng的pGL4.47以及400ng 01/11 12:17
belle0625070: 的DNA 01/11 12:17
belle0625070: 感謝大家意見,明天馬上先選一組DNA測試看看1ng per 01/11 12:22
belle0625070: well renilla 在ffLuc/rLuc還有血清與抗生素移除與 01/11 12:22
belle0625070: 否的差別。 01/11 12:22