[求救] 急QQ想請問WGCNA的一些問題

[inake24 (ggbear要提出來是我想的)]

https://i.imgur.com/EPDcmi5.jpg

如圖
作者從組織中找出基因後
利用WGCNA還有還有其他生資的方法如GeneOtology或是IPA等等方法來對這些找出的基因
做分析

關於這張圖我的理解是
作者把這些基因用表達量變化的pattern分為八大類
把每一大類中主要參與的基因種類定義成各個function
並且從每一大類中找出最具代表性的example gene

但是問題來了

（1）
如果真照我想的
為什麼function 那欄
第2、5、6大類都叫做neuronal呢 後面那個10^-7
10^-6 以及10^-5又是什麼意思


（2）
https://i.imgur.com/sUtTN82.jpg

後面作者說
他把每一類的基因表達量作平均
並用皮爾森係數來看每一類每一類的基因之間
的相關度
想請問這個做的目的是什麼（為什麼可以把數個基因表達量作平均之後才來比較，不是有
正負之分嗎）
圖的右邊有一個相關度
為什麼只看正值呢



我知道這個問題可能不難
可是對於從未碰過相關領域的我真的是被搞的一個頭兩個大QQ
附上原文連結
http://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(18)30006-8

麻煩大家幫幫我了 還有好多好多問題想問

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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 1.34.55.79
※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1522572026.A.B2A.html
※ 編輯: inake24 (1.34.55.79), 04/01/2018 16:41:16
※ 編輯: inake24 (1.34.55.79), 04/01/2018 16:51:11
→ blence: 這是要看懂,要報告,還是有data要跑? 什麼領域? 不熟IPA?
是要報告的 上面那些問題大多是先報告實驗室學長姐聽之後他們問的問題，我找不太到
答案
實驗室的領域是做動物實驗跟分生較多的
所以比較不了解..
※ 編輯: inake24 (1.34.55.79), 04/01/2018 17:23:11
推 july81212: 你可能先去了解WGCNA怎麼分析（demo蠻淺顯的)會比較了
→ july81212: 解這篇@@