看板 Biotech 關於我們 聯絡資訊
各位大大好,小弟剛跨入生物資訊領域, 在看一個enhancer-gene interaction資料庫時, 不是很清楚其中的gene id欄位為何, http://enhanceratlas.org/download.php 其內容大致如下: chrX 153597160 153598700 91814 chrX 153607985 ENST00000492448 ... chr1 1499170 1500150 116 chr1 1243947 ENST00000379031 ... 有找到欄位說明: http://enhanceratlas.org/Data_format_EP.txt 對於第4欄的id,試著用NCBI id查詢但對應不到, 不知道是否enhancer有常用的id表示? 感謝! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.112.4.206 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1524644693.A.AA6.html
lelojack: Gene ID - A number taken as the gene id @@ 04/25 21:55
lelojack: 我測試過 應該不是常用的資料庫而且說明寫得很曖昧 04/25 21:56
lelojack: 建議用後面ensembl Transcript id來對基因名稱 04/25 21:57
yp1369: 好喔!感謝 04/26 00:31