作者Shalexx (啃琳)
看板Biotech
標題[求救] primer predict
時間Fri Jun 15 16:21:24 2018
------我是菜逼八碩一如果提出很菜的問題可以罵但請各位大大罵完還是能幫個忙解答--
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最近在嘗試把一隻放線菌的ori用pcr的方式挑出來,但設計出來的primer F會亂黏,所以
要重新設計primer。
教授要我設計完去predict看看primer會不會再亂黏(上次忘記先predict),想請教各位
大大整個放線菌genome大概三百萬mer(超大),有沒有什麼軟體是適合這麼大的genome
。
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→ xxtomnyxx: NCBI primer BLAST 系統就可以做了,不過我不知道 NCBI 06/15 18:22
→ xxtomnyxx: 有沒有 Actinobacteria 的 genome sequence 06/15 18:23
→ Shalexx: 謝謝~~~ 06/16 00:06
→ Shalexx: NCBI都只有片段 這也是個問題 06/16 00:07
→ supray: 提醒一下 看專一性primer blast不用自己貼Template 06/16 01:28
→ supray: 底下物種選對 整個genome就幫你比對了 06/16 01:29
→ supray: 放射菌屬的genome有喔 但只能比nr資料庫 06/16 01:30
→ Shalexx: 好的~~~謝謝 06/16 16:40