[求救] 16smetagenomcis與培養法的結果不同?

[jming (PETER J)]

發問時請注意，若是要問實驗相關的問題，請將實驗的步驟、所用的條件大致列出
以方便板友幫您追蹤問題

若是求救事項涉及實驗室智慧財產(例如細胞細菌植株、質體載體等）之分讓，
請務必註明貴實驗室願意設立 正式合作或 簽署材料分讓協議(MTA)，否則版工將逕行刪除

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請教各位學長姐,在環境採樣後進行微生物培養與菌種鑑定及16S rRNA metagenomics
的分析後,結果發現培養法中CONS分離最多,但在metagenomics結果分析上以不動桿菌屬
最為豐富.造成這樣結果如何解釋?

培養法與16S rRNA metagenomics結果不同地方在哪?

我知道培養法能分離出活菌種,但有99%以上的環境菌無法培養
metagenomics是可以分析培養法無法分離培養的菌
謝謝

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→ Ianthegood: 所有的培養都是enrichment 只有喜歡你的培養環境的會
→ Ianthegood: 長
→ owl9813: 結果不同的地方是指什麼？請表達清楚
→ jming: 我培養法培養出Cons菌種最多
→ jming: 但在16s metagenmic葡萄球菌屬不是很豐富
推 sisley: 活菌死菌的差異也會有影響，NGS死活都看，培養法只看活菌