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各位前輩好,下圖為打Mass後的結果圖,樣品是二維電泳中不確定的點,想請問該如何從 圖中的資訊判定該點為何種蛋白,該參考哪些資訊,非常感謝各位的幫助 https://i.imgur.com/o5XBYar.jpg -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 101.13.41.252 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1543435519.A.3AD.html
Ianthegood: 序列一條一條copy起來去blast啊不然勒 11/29 07:24
jeffchu731: 大大,不好意思,小弟門外漢,能否講的詳細一些,感 11/29 08:41
jeffchu731: 謝 11/29 08:41
lelojack: 你選擇大鼠資料庫,若沒找到結果,可以用 blast 來搜尋 11/29 08:46
lelojack: 其他資料庫;blast是序列的google工具 11/29 08:46
xxtomnyxx: 這是我第一次看這種報告,如果我搞錯還請指正,這報告 11/29 13:10
Anvec: 這應該可信度不低吧 質譜打出的片段 有對到CYTB_RAT 3個位 11/29 13:13
Anvec: 置 佔了全部序列的79% 11/29 13:13
Anvec: 因為用 Trypsin 切 每段的屁股都是K 11/29 13:14
xxtomnyxx: 不就寫了樣本比對結果是 Rat 的 Cystatin B 嗎? 11/29 13:15
Anvec: 啊 5段序列 11/29 13:15
xxtomnyxx: 連胺基酸對應到的部份都列給你了耶?下面那些個別的序 11/29 13:16
xxtomnyxx: 列就是中間那 Matched peptides shown in Bold Red 中 11/29 13:17
xxtomnyxx: 的部份啊 11/29 13:17
july81212: 79% coverage應該就是了 不過peptide 沒給斷片資訊第 11/29 17:20
july81212: 一次看到@@ 11/29 17:20
july81212: Miss 是指trypsin missing cleavage 的peptide 段 11/29 17:25
jeffchu731: 好的,十分感謝樓上各位的協助~小弟了解了 11/29 19:31