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請教各位熟悉PCR機器的高手 正常的PCR機器應該要在幾秒內的誤差到達指定溫度? 我有使用外接的PROBE偵測well內的實際溫度 我的program是 94c 30s 57c 30s 66c 45s 實際測量發現從94到57的時候, probe的溫度剛降到61度時,機器已經開始讀秒, 而當probe顯示真正降到57度時,時間已過了15秒以上了, 其他的step也是這樣,大概都要過10-15秒才能真正到達指定的溫度 請問這樣是正常的嗎 因為我做的是multiplex PCR,最近發現很容易出現non-specific band 會是因為機器溫度sensor壞了之類的關係嗎 麻煩高手幫忙解惑了 感謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 60.250.101.162 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1544154797.A.B67.html
hitmd: 我猜應該是機器的特性,防止加熱或降溫過頭,所以接近溫度 12/07 12:34
hitmd: 時會降低速度後逼近設定溫度,至於為何先讀秒就要請廠商問 12/07 12:34
hitmd: 問原廠,是說是哪個廠牌的呢? 12/07 12:34
GDCOC: Cole-Parmer 12/07 13:12
blence: 什麼是"幾秒內的誤差到達指定溫度",是指94到57度的時間? 12/07 14:09
blence: 你是發現機器已經顯示到57度開始數秒,可是實際溫度才61度? 12/07 14:11
blence: 你是認為probe跟機器同時顯示57度時只剩15秒,所以不OK嗎? 12/07 14:13
GDCOC: 對,實際才61就開始數秒,這樣我指定30秒不就沒有意義了 12/07 16:38
GDCOC: 真正作用在57度的時間只有15秒而已 12/07 16:39
GDCOC: 因為沒測過其他牌子也不知道這種情況是不是正常的 12/07 16:39
blence: 先不考慮機器有無問題,純看你的擔憂是多慮了 12/07 17:22
blence: anneal在高溫不會亂黏,低溫才容易有non-specific band 12/07 17:22
blence: 而且就算你認為61->57度不該讀秒,primer就不會偷跑嗎? 12/07 17:23
blence: 還是擔心的話,把anneal設成45秒就不怕時間不夠了 12/07 17:23
blence: 如果是溫度顯示不準確或定溫後會明顯跳動,問題才大 12/07 17:27
Ianthegood: 很多機器可以設ramp 不過會真的去測的你是我聽過的第 12/07 17:35
Ianthegood: 一個 推一個 12/07 17:35
Ianthegood: pcr大概都是peltier element 測溫跟加熱算是一起的 12/07 17:39
Ianthegood: 所以應該沒壞 大概是設計就是這樣 那你也只能在這台 12/07 17:39
Ianthegood: 機器的特性下去修改你的條件(buffer, program,etc) 12/07 17:39
Ianthegood: 所以寫paper才要寫明機器的牌子XD 12/07 17:39
xxtomnyxx: 很重要的一點,PCR 機器沒辦法直接去測sample的溫度, 12/07 18:29
xxtomnyxx: 只能用加熱板上的seneor取得加熱板的溫度,而加熱板的 12/07 18:30
xxtomnyxx: 的溫度並不代表sample的溫度,所以大部份機器跑PCR時才 12/07 18:31
xxtomnyxx: 會要你設定反應體積,這是用來讓機器「估計」加熱板達 12/07 18:32
xxtomnyxx: 到指定溫度時sample理論上要多久才會跟著達到這個溫度 12/07 18:33
xxtomnyxx: ,直接用probe測會不準很正常,PCR溫度校正也都是校正 12/07 18:33
xxtomnyxx: 加熱板的seneor,所以是指定一個溫度後看probe最後的終 12/07 18:34
xxtomnyxx: 點溫度是否和設定一致,而不會去檢測加熱達到指定溫度 12/07 18:35
xxtomnyxx: 時probe的溫度是否正確。 12/07 18:35
jabari: 你拿三個水浴鍋作看看 12/07 21:13
Ice9: 就算拿三個鍋做實驗,還是會有samples升降溫時間問題 XDD 12/08 05:53
Ice9: 另推原PO的觀察實測精神。 12/08 05:55
untilnow: 你的probe有校正過嗎 12/08 11:23
aaaazzzz: 推樓上BIX大的解釋,也對原PO實測溫度表達敬意 12/08 14:54
GDCOC: probe有校驗過喔,另外,我後來找了一台ABI9700來測, 12/10 11:04
GDCOC: 他的升降溫會稍微超過1-2度,然後再拉回來 12/10 11:05
GDCOC: 倒數計時也是差不多到指定溫度才開始計時,不會差超過2度 12/10 11:06
GDCOC: 可能真的是機台設計不同,這樣在使用IVD產品的時候, 12/10 11:12
GDCOC: 更改pragram內容對於實驗室認證會有困擾>< 12/10 11:13
GDCOC: 感謝各位的解釋&建議 12/10 11:14