看板 Biotech 關於我們 聯絡資訊
版上前輩們好, 我是最近剛開始做cloning實驗的新手, 但因為cloning一直失敗, 盤不是長不出colony,不然就是直接長爆... 經由PCR check後也都沒有成功... (有換過新的digestion enzyme, 也有試過在不同溫度下ligase, 以及不同的ligase時間長短) 所以打算用實驗室之前已經存好的菌株下去做subcloning, 但因為學長沒有存到DH5a的菌株, 只有存到E. coli S17的菌株, 所以想來版上請教前輩們, 請問以S17這隻菌作為宿主的話, 我還能抽它的質體繼續做subcloning的實驗嗎? 感謝指教!!! ----- Sent from JPTT on my Sony F5121. -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 39.9.138.29 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1546847081.A.0BA.html ※ 編輯: Faustus73 (39.9.138.29), 01/07/2019 15:48:43
turtle24: 是指學長留下的質體subclone都失敗才想從S17純化質體嗎 01/07 16:15
turtle24: 那我會多花一點心思在確認學長的plasmid map正不正確 01/07 16:17
有噢,我是兩邊同步在進行的。原先的菌株抽完質體送定序後的結果,跟學長map中的cut site沒有產生突變,而且digestion後的跑膠結果,band的長度也和預期的差不多,但是怎麼接就是接不起來,盤總是不長colony...。剛好有找到這隻存在S17的基因序列有我實驗需要的片段,所以才考慮要從這隻菌下手,做subcloning。
turtle24: 重新塗盤挑幾個菌落切切看酵素跟map有沒有一致 01/07 16:18
※ 編輯: Faustus73 (39.9.138.29), 01/07/2019 16:32:31
agagy: 同上,序列跟抗性一定要對,做cloning最怕用前人的材料了 01/07 16:40
agagy: insert有確認過的話,那vector呢?長爆的話可能是單一切點 01/07 16:45
agagy: 所以自接? 01/07 16:45
turtle24: 如果有人帶著做troubleshooting會比較快知道原因 01/08 09:26
turtle24: 沒人帶的話控制組跟紀錄本都要妥善,至少老師能幫你看 01/08 09:27
MADAOTW: transformation後挑菌前, 用 Protoplasting assay 看到 01/13 13:34
MADAOTW: 底是不是正常的 insert 01/13 13:34
MADAOTW: 最好的情況是能挑20顆以上clones 作初篩 01/13 13:44
blence: 別亂教叫人挑這麼多顆好嗎?這樣不叫troubleshooting 01/13 14:44
xxtomnyxx: 會成功的 cloning,挑 1 顆,最多 3 顆就該挑到正確的 01/13 17:09
xxtomnyxx: clone 了,不會成功的 cloning,你挑 100 顆,就算給你 01/13 17:09
xxtomnyxx: 挑到了 1 顆正確的,你將來還是不會做 cloning。 01/13 17:09
Ianthegood: 我覺得很多e coli裡面發生的事情都還未知 多挑幾顆真 01/14 04:09
Ianthegood: 的無妨 我colony pcr一次也都一盤XD 01/14 04:09
blence: 如果挑出的clone除了on target外容易有off target,是需要 01/14 10:51
blence: 多挑幾顆,如果都是可預期的no target,怪菌Ecoil是無辜的 01/14 10:53
Ianthegood: 隨手狗了一下 s17是cloning strain沒錯啊 所以B大說得 01/14 17:03
Ianthegood: 對 Ecoli是無辜的 01/14 17:03
turtle24: 學生挑20個菌結果我被老闆洗臉… 01/15 08:14
turtle24: 我自己是挑6顆,定序送2顆 01/15 08:15
turtle24: 可是學生不是我帶的… 01/15 08:16