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各位前輩好~~ 由於小弟是化工系對於電泳圖的判讀不太了解,請各位前輩多多指教~ 以下是小弟使用自製的pcr平台所跑出來的沙門氏菌DNA電泳圖(目標位置200bp) https://i.imgur.com/gPtlVAJ.jpg
請問各位前輩圖中band的位置過高,有可能是什麼原因所造成的? 謝謝大家~~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 36.234.58.80 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1556895334.A.F31.html
milkpa: all genomic DNA 05/04 00:32
Bows: PCR失敗 05/04 01:18
t5r4e3w2q123: 請問樓上兩位前輩造成失敗的原因是因為DNA未打開嗎 05/04 07:49
t5r4e3w2q123: ? 05/04 07:49
lelojack: 你們的band跑的不錯欸 05/04 08:32
as862437: PCR 失敗沒東西,最上面的是gDNA 05/04 10:15
turtle24: 總覺得這是1kb marker, 最下面是500bp嗎 05/04 10:29
turtle24: 或250bp 05/04 10:29
t5r4e3w2q123: T大前輩最下面是100bp 05/04 10:47
ernielwl: 1.marker大小要標示出來,你在做報告的時候最好也這樣 05/04 11:44
ernielwl: 對別人判斷上會比較容易了解 05/04 11:44
ernielwl: 2.sample條帶跑在marker最大片段位置甚至更上方一些 05/04 11:45
ernielwl: 這個是genomic DNA, 如果實驗有經過pcr那結果是失敗的 05/04 11:46
ernielwl: 3.做pcr之前你的template最好可以定量一下,下pcr的量不 05/04 11:47
ernielwl: 要太多 05/04 11:47
ernielwl: 最後三個跑道明顯是過量了.... 05/04 11:47
t5r4e3w2q123: 好的謝謝E大前輩的建議,不過我是同一管pcr試劑下去 05/04 12:02
t5r4e3w2q123: 做實驗的,條件只有調整pcr溫度 05/04 12:02
jsi: 樣品若是agar上的菌落,用無菌tip尖端沾一下菌落,少到幾乎看 05/04 12:36
jsi: 不到的量作為pcr template。樣品若是菌液或DNA,可搜尋網路上 05/04 12:37
jsi: pcr template amount有建議用量,若沒有定量儀器,可以試著將 05/04 12:38
jsi: 菌液或DNA作數個10X連續稀釋,分別做為template進行PCR,應能 05/04 12:40
jsi: 看見結果。有問題可再把結果放上來詢問看看。 05/04 12:41
ernielwl: primer加錯或是專一性不足,Taq沒加到或壞掉 05/04 15:35
ernielwl: annealing溫度不對,這些都有可能 05/04 15:36
ernielwl: 實驗新手最好還是有一個人可以帶著你做一次 05/04 15:38
t5r4e3w2q123: 謝謝各位前輩的建議~~ 05/04 15:52
lail: 有positive control嗎?確定primer都可以用,且試劑都沒問題 05/04 18:35
beraks: 我的經驗是沙門氏菌不用純化genomic 05/06 10:17
beraks: 培養液25/1就跑的出來,我是跑invA 05/06 10:18
qiet: 要有positive control阿, 不只是sample, 连PCR平台也是要用 05/06 13:45
qiet: 确定是能用的机器来跑, PCR条件也都要确定 05/06 13:45