牛的RNA Variant DNA Varient

[ChenJhih (ChenJhih)]

https://i.imgur.com/TKvOota.jpg
小弟最近在研究牛的基因，想知道如何從e!semble這個網站獲得RNA Variant、DNA Varie
nt。（目前只知道上圖的T/C是RNA Variant ...)
麻煩各位大神指點

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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 115.82.232.170
※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1557845052.A.76C.html
→ Ianthegood: 有看到上面有一個tab寫help & docs嗎? 那個點下去
→ blence: 你搞錯了，給的附圖是DNA variant阿
→ ChenJhih: 我一開始認為是DNA variant，不過傳mail問journal作者
→ ChenJhih: 跟我說是RNA variant...
推 lelojack: VCF:29ꂠ46165505ꂠrs42194371ꂠTꂠC，這代表是染色體29
推 lelojack: VCF:29 46165505 rs42194371 T C這是代表染色體29號的
→ lelojack: 位置，染色體只有一個方向，所以是DNA變異
→ ChenJhih: 感謝各位的回答，我要去嘴砲論文作者了（開玩笑）
→ ChenJhih:  https://i.imgur.com/5VA3Jsx.jpg  這是作者的回覆，他
→ ChenJhih: 講的同樣是上圖，想請大神求助...
推 lelojack: 你們真的是照SNP id在討論嗎？ 沒有前後文沒法判斷教授
→ lelojack: 是不是有誤解，建議你去找生資夥伴討論細節
→ xxtomnyxx: 呃....我記得 DNA variant 和 RNA variant 概念上是不
→ xxtomnyxx: 一樣的東西，因為 RNA 是以 DNA 為模板做出來的，所以
→ xxtomnyxx: DNA variant 會直接反應在 RNA 上(如果這個 DNA varian
→ xxtomnyxx: t 位於會做出 RNA 的序列上)；RNA variant 應該是指在
→ xxtomnyxx: transcription 時，由不同的TSS、alternative splicing
→ xxtomnyxx: 或使用不同 polyA signal 而產生不同的 RNA 產物，這無
→ xxtomnyxx: 官 DNA 序列有無不同都會產生，雖然 DNA variant可能影
→ xxtomnyxx: 響能產生哪些 RNA variant，但他們概念上應該是不同的
推 lelojack: 網站中已經有寫到RNA變異NSBTAT00000068819.1:c.*1324A>
→ lelojack: G，我猜是認知不同造成的差異