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最近在幫老師處理一批PAS染色的組織切片 透過ImageJ的插件將圖片拆成藍跟紅後可以設定Threshold 順利定量出Positive staining area percentage 但老師希望能夠更進一步地去看Staining intensity 但是不管怎麼google都找不到適合的方法 看到有人說把Mean gray value打開就是mean intensity 但是我後來看了一下定義好像不太對 想知道有什麼方法可以把染色的intensity測出絕對的數值? 因為Glomerulus裡面會有一些空洞 想說能不能圈起一顆glomerulus後, 程式自己讀出這顆glomerulus整體被染色的強度 自然就會排除掉空洞的影響。 真的找不到合適的方法, 希望有經驗的各位可以提供你們使用imageJ的經驗 或著其他軟體我也可以試試看 先謝謝各位了! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 120.126.49.54 (臺灣) ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1565085558.A.B5B.html
loveoldbear: MetaMorgh? 08/06 20:27
剛有稍微查一下,貌似功能滿豐富的 但看起來好像是需要由學校購買授權 這樣現在就沒辦法用了 可惜 但還是謝謝 ※ 編輯: steve42125 (1.161.17.53 臺灣), 08/06/2019 20:31:30 ※ 編輯: steve42125 (1.161.17.53 臺灣), 08/06/2019 20:37:01
tynse71864: 我是想到用 imaris, 但這應該比 metomorph難借到… 08/06 21:56
wanderchang: Mean Intensity*Pixel number = Integrated Int. 08/08 18:14