→ Qaaaa: 沒錢啦 不然基因體蛋白質體通通做啊 05/23 14:31
→ Qaaaa: 而且台灣其實做很多 是不是有意義的研究不知 但並不少 05/23 14:33
→ Qaaaa: 因為你會拿到滿手資料 但下一步要做什麼很多人沒想法 05/23 14:35
→ blence: 前置準備不易...跟RNA比我覺得是這個 05/23 15:01
→ xxtomnyxx: 基因體就抽個RNA就可以送了，蛋白質體...... 05/23 20:05
→ xxtomnyxx: 就算你 IP 到目標蛋白，你要拿什麼當 positive control 05/23 20:06
→ xxtomnyxx: 證明樣本中有 co-IP 到目標與蛋白有作用的其他蛋白？ 05/23 20:07
→ xxtomnyxx: 還要想辦法排除非專一IP的問題，搞個3年都不見得能解決 05/23 20:08
→ grazzilybear: 錢應該是個問題。所以另外問題是數據分析囉？但基因 05/23 23:49
→ grazzilybear: 體數據也是龐大？若是IP實驗目前許多實驗室的文章 05/23 23:49
→ grazzilybear: 都證明IP已經不太是問題。相對基因體蛋白體不是才是 05/23 23:49
→ grazzilybear: 有function 的表現甚至可以幫你看PTM? 05/23 23:49
→ blence: 或許不是很正式的比較,我送一個pulldown鑑定約10k,RNAseq 05/24 00:12
→ blence: 約30k,反而比較便宜 05/24 00:12
→ blence: 說前置準備,RNA有kit,隨便60mm dish細胞收的量就可以送 05/24 00:12
→ blence: 做蛋白鑑定,像IP可能要求起始量500ug以上,其它還有要求 05/24 00:12
→ blence: 自己先做膠體純化,自己換buffer,或濃縮等等 05/24 00:14
→ blence: 對許多實驗室而言,蛋白體服務就不是那麼友善 05/24 00:17
→ xxtomnyxx: RNA別說60mm dish，我用12-well單孔抽的送去廠商都誇 05/24 00:29
→ xxtomnyxx: RNA品質非常好了，但是連用100mm dish做的IP都不一定壓 05/24 00:30
→ xxtomnyxx: 的到之前YTH證明過會有交互作用的蛋白。然後數據分析 05/24 00:30
→ xxtomnyxx: 我認為反而是最不困難的，現在有太多分析可以做，在已 05/24 00:31
→ xxtomnyxx: 經有candidate的狀況下co-IP打MASS出來的一堆蛋白中有 05/24 00:32
→ xxtomnyxx: 那麼幾個可以和candidate的pathway扯上關係，就把那幾 05/24 00:33
→ xxtomnyxx: 個往死裡打就好了。 05/24 00:33
→ grazzilybear: 感謝各位解說，那如果有一個中心你們只需把樣品給他 05/24 00:36
→ grazzilybear: 們後續什麼步驟都能幫你們完成，並且提供初步數據 05/24 00:36
→ grazzilybear: 解釋那你們會想要跨蛋白體這領域嗎？ 05/24 00:36
推 cyc5566: 這樣的確很有吸引力 05/24 00:56
→ blence: 給個樣品是很模糊的說法,是包括代做IP嗎？ 05/24 01:03
→ blence: 如果一般的protein assay的樣品可以無縫轉送服務,就可以 05/24 01:05
→ blence: 或至少讓人不排斥使用蛋白體分析 05/24 01:07
→ xxtomnyxx: 目前我知道最多的只有到可以送resin，廠商從elute開始 05/24 01:24
→ xxtomnyxx: 做，如果要到送lysate，技術部門的IP能力是個考驗，然 05/24 01:26
→ xxtomnyxx: 而一但口碑建立起來，這絕對有市場 05/24 01:26
→ grazzilybear: 對，從IP開始。或是其他生物實驗只要你們做好生物 05/24 02:28
→ grazzilybear: 的加藥或是任何動物實驗後面交給專業團隊做lysis定 05/24 02:28
→ grazzilybear: 量等等等蛋白質體實驗。我的想法是業界通常不可能 05/24 02:28
→ grazzilybear: 為了蛋白體實驗多訓練或聘人，若有一個core可以包 05/24 02:28
→ grazzilybear: 辦這些事情的話可能不錯 05/24 02:28
推 lingon: Proteomic 實驗貴, 分析師難找, 要收支平衡不簡單 05/28 03:47
推 captdavince: 曾經想做，收了樣本，送了蛋白質體的實驗室，但是回 05/28 13:11
→ captdavince: 來的data也一頭霧水.就這樣一直放著 05/28 13:12
推 jeff790906: 就我所知 目前沒辦法做到每個protein的絕對定量 應用 06/11 21:20
→ jeff790906: 會受限 06/11 21:20