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因為構築好的質體之後要來產蛋白 但小弟是新手,不確定這樣設計是否會有什麼問題 1.會有其他雜band出現嗎? 2.我的那段insert前面的T7 promoter因為離insert有點距離,所以我在設計insert的時 候, 前面加了start codon,這樣會有蛋白做不出來的問題嗎? 3.圖中的insert大小是414bps,還有另外的是369bps,這樣在跑WB後,跑出來的結果是不 是會滿靠近的? https://i.imgur.com/Udqt0hS.jpg
-- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 42.73.234.44 (臺灣) ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1603373875.A.5CE.html ※ 編輯: nm768417 (42.73.234.44 臺灣), 10/22/2020 21:42:19 ※ 編輯: nm768417 (42.73.234.44 臺灣), 10/23/2020 01:56:32 ※ 編輯: nm768417 (42.73.234.44 臺灣), 10/23/2020 01:57:30
xxtomnyxx: 還是那句老話:問問題請把問題描述清楚。 10/23 11:02
xxtomnyxx: 1. 雜band?是做什麼實驗的?切 RE?PCR?WB? 10/23 11:02
xxtomnyxx: 2. 你給的圖上沒有T7 promoter(雖然我看的出來在哪裡) 10/23 11:02
xxtomnyxx: ,請你標記好。 10/23 11:02
xxtomnyxx: 3. 在問這個問題前,你有先去理解過WB的原理嗎?如果 10/23 11:02
xxtomnyxx: 有,請問你用什麼一抗? 10/23 11:02
Marriott: 你是有refolding相關需求才用pET32a? 若不是,你要想 10/23 11:02
Marriott: 想到時候你目標蛋白N段前面可是會多不少東西啊 (前面 10/23 11:02
Marriott: 已經有atg,你加不加都無所謂),到時候還要多一道切的 10/23 11:02
Marriott: 步驟 10/23 11:02
xxtomnyxx: 如果你希望insert獨立做出一個蛋白,那除了ATG以外還 10/23 11:10
xxtomnyxx: 要放Shine-Dalgarno sequence,而且還要放stop codon 10/23 11:10
xxtomnyxx: 終止前面TrxA蛋白的轉譯;如果你要做一個insert和TrxA 10/23 11:10
xxtomnyxx: 的fusion protein,那加不加ATG都無所謂。 10/23 11:10
nm768417: 感謝各位大神回覆,抱歉可能我問題沒有問的很清楚,我 10/23 11:44
nm768417: 的質體目的是想做出insert的獨立蛋白,進而表達出抗原然 10/23 11:44
nm768417: 後去偵測血清中的抗體,然後有看到回覆的留言,有看到要 10/23 11:44
nm768417: 加入shine-dalgarno sequence還有stop codon,我想請問 10/23 11:44
nm768417: 一下這個要怎麼加入到insert上,加上去的話的順序是stop 10/23 11:44
nm768417: codon-酵素切位-shine-dalgarno sequence-AUG-insert 10/23 11:44
nm768417: 嗎,抱歉我是菜鳥大學生 10/23 11:44
Ice9: 等等,大學生?實驗室沒有前輩嗎? 10/23 16:36
nm768417: 實驗室沒有碩生跟博生也沒有助理 10/23 17:51
Ianthegood: 老闆放生嗎?這大概是碩班題目的難度? 10/23 22:08
tynse71864: 等等沒有碩博也沒助理只有專題是怎樣囧 10/24 00:09
rebirth: 你要不要換實驗室比較快阿 10/24 10:09
rebirth: expression vector基本設計問題實驗室沒人可教只能上網 10/24 10:11
rebirth: 問網友... 10/24 10:11
tynse71864: 但還是想辦法解決下好了 是說 stop 跟 start codon 10/25 13:06
tynse71864: 應該寫反了? 10/25 13:06
tynse71864: 喔我看錯了, 你寫的應該是對的, insert尾巴還要再一 10/25 13:10
tynse71864: 個stop。另外跑膠理論上只會有一個 band 但實際上要 10/25 13:10
tynse71864: 跑了才知道 10/25 13:10
nm768417: 感謝樓上大神指導,那stop codon要怎麼加上去?因為是 10/25 14:29
nm768417: 酵素切然後黏上去vector上,這樣不是要加在6-his tag後 10/25 14:29
nm768417: 面嗎? 10/25 14:29
xxtomnyxx: 單就這個 vector 的設計和製做大概是大學專題生水準, 10/25 15:16
xxtomnyxx: 包含血清測試整套做完差不多就是碩班題目。你現在大幾 10/25 15:17
xxtomnyxx: ?原核生物的轉錄轉譯調控學過了嗎?知道 ORF 的 frame 10/25 15:18
xxtomnyxx: 是什麼嗎?知道你的程度比較方便告訴你要怎麼做。 10/25 15:19
vivitune: 5’-切位-start-你的基因-3’ 10/25 20:02
vivitune: 5’-切位-stop-你的基因-3‘ 10/25 20:02
Ice9: 問網友反饋花的時間比較長。試試找其他實驗室學長姐會比較 10/25 21:03
Ice9: 快。另外,現階段你需要那些背景知識也可以由他們協助。 10/25 21:03
rasaze: 良心建議既然實驗室放生你,就放生實驗室吧,把時間拿去 10/31 14:44
rasaze: 補充基本知識甚至精進英文也比在這間實驗室浪費時間好 10/31 14:44