作者zzzz1234 (zzzz)
看板Biotech
標題[求救] 米酒中微生物RNA抽取多醣污染
時間Tue Dec 22 16:52:53 2020
大家好，我要抽的材料是發酵中米酒裡面微生物(大部分是酵母)的RNA，我在取樣後先將
樣品離心500g 40秒，取上清液將較大顆的米粒去除後再離5000g 5分鐘把菌離下來，去除
上清液(還是有一些糊化的米混合在下面的菌裡面)之後再開始用trizol來抽取RNA，在最
後用isopropanol沉澱RNA的時候會有出現多醣體的污染。目前已經試過(0.8M檸檬酸鈉+1.
2M氯化鈉)搭配isopropanol一起沉澱了，雖然有減少沉澱出來的多醣體，但是還是無法完
全去除，嚴重影響到抽出來的RNA濃度，想請問是否有什麼地方可以改進或是其他方法呢?
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推 Ianthegood: TCEP 植物常用 12/24 17:59
推 Ianthegood: CTAB才對抱歉 12/24 18:00
推 huuban: 有糖的東西TRIzol容易抽不動..建議CTAB或PureLink Plant 12/25 00:34
→ zzzz1234: 不好意思想請問一下CTAB是常用來抽植物RNA用的那我拿來 12/25 12:37
→ zzzz1234: 抽這個樣品中的酵母菌RNA會有影響嗎? 12/25 12:37
→ zzzz1234: 另外還想詢問一下SDS的話是否可以使用? 12/25 12:49
→ robbercat: 你可以參考下面yeast RNA extraction method 此外SDS 12/27 10:23
→ robbercat: 是可以使用的 12/27 10:23
→ robbercat: na-isolation 12/27 10:23
→ zzzz1234: 感謝!!我會試試看protocol 12/28 11:39