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想請問關於PVDF pore size和protein size 有點好笑(?)的問題 實驗室最近想壓一個約15kda的protein 原本用.45 PVDF壓出來的效果覺得不是很好 有聽過說壓小分子protein可以選擇用.22 um的會比較好 但是因為同時會需要看約130kda的protein 想請問會有可能因為換了.22 PVDF後導致大protein卡不進洞裡(?)而tran不過去 或是因為其他的原因使得大protein變得難壓嗎? 還是說.22的吸附能力就是比.45強 經濟許可下.22一定會是最首選呢? 謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 120.126.50.146 (臺灣) ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1627193134.A.3D5.html ※ 編輯: steve42125 (120.126.50.146 臺灣), 07/25/2021 14:08:12
r03b43022: 大的蛋白質應不至於transfer 不過去 07/25 16:48
謝謝您的回覆,我後來想想自己問的問題好像有點白痴 如果真這樣過不去,大家平常.22過無菌應該一堆東西就都不見了XD 但還是想問問大家實際上的經驗 ※ 編輯: steve42125 (120.126.50.146 臺灣), 07/25/2021 16:56:42
xxtomnyxx: 如果你知道PVDF是怎麼黏蛋白質的,就不會覺得會「卡不 07/26 09:07
xxtomnyxx: 進洞裡」了。 07/26 09:07
xxtomnyxx: 我家一直用 .45 的PVDF,一張上面同時要看1x kDa 和~ 07/26 09:14
xxtomnyxx: 200 kDa 是家常便飯,如果你懷疑因為蛋白質太小穿過PV 07/26 09:14
xxtomnyxx: DF,可以先試試看transfer時放兩片PVDF,然後比較看看 07/26 09:14
xxtomnyxx: 兩片PVDF上的染色結果。 07/26 09:14
我後來也覺得我問這個問題真的是有點愚蠢(汗 兩片PVDF我覺得是一個很好的嘗試 謝謝您的建議,我會試試看!
tynse71864: 不會; 倒是可能轉漬時間或 bfr等原因 導致130的轉漬 07/26 13:38
tynse71864: 效果不好 07/26 13:38
看起來得多試試幾個條件 ※ 編輯: steve42125 (120.126.50.146 臺灣), 07/26/2021 15:04:17
xxtomnyxx: 我自己有測試過,transfer buffer的配方影響非常大, 07/26 22:20
xxtomnyxx: 有沒有加SDS、SDS的濃度、用的是 Towbin、2x Towbin 還 07/26 22:24
xxtomnyxx: 是 Bjerrum Schafer-Nielsen Buffer?反而methanol濃度 07/26 22:24
xxtomnyxx: 10% 和 20% 沒什麼影響,那次測完才知道我原本用的系統 07/26 22:25
xxtomnyxx: over transfer 非常嚴重,可能有10%~25%的蛋白質都穿過 07/26 22:25
xxtomnyxx: 去了..... 07/26 22:26
沒想過調condition真不知道裡頭大哉問 好好來研究研究.....
tynse71864: 其實15kda用.45可以啦 不要轉太久就好 我以前常做 07/27 13:23
好的,感謝建議! ※ 編輯: steve42125 (120.126.50.146 臺灣), 07/27/2021 13:51:25
Ianthegood: 順便借問一下 一樣差不多130的膜蛋白有什麼好用的tran 07/27 19:49
Ianthegood: sfer buffer condition嗎? 07/27 19:49
我們原本是用5.8g Tris+2.9g glycine+5ml 10% SDS+800ml 水 然後調pH到9.2再補200ml methanol 400mA transfer 1小時 溼式的 僅供參考XD ※ 編輯: steve42125 (120.126.50.146 臺灣), 07/28/2021 08:17:18
blence: 為什麼要調pH? 07/28 19:46
blence: 如果%偏高的話,400mA/1h應該會有些high MW還在膠上 07/28 19:48
osla30: 調pH不會降低緩衝能力嗎? 07/28 19:50
xxtomnyxx: 你的 transfer 是半乾還是濕式?如果是濕式,你的 TB 07/28 21:41
xxtomnyxx: 配方看起來是 Bjerrum Schafer-Nielsen Buffer + 0.05% 07/28 21:42
xxtomnyxx: SDS,我直接告訴你,這個就是我說的「原本用的會有大量 07/28 21:43
xxtomnyxx: 蛋白直穿過去的系統」 07/28 21:43
darrenyo: 小protein transfer 建議不要加SDS 容易過頭 07/29 07:22
raiyu: 不是有marker嗎? 07/31 20:16
raiyu: 我們家289kDa跟8kDa的都用一樣的buffer跟膜 07/31 20:20