[求救] paper問題 拜託幫忙

[abeautiii (小燕子)]

各位先進好，有一些paper問題想請教

Paper標題：Tissue-resident memory CAR T cells with stem-like characteristics d
isplay enhanced efficacy against solid and liquid tumors
連結：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10313923/

主要是圖看不太懂，很多圖都是第一次看到，雖然上網查了很多資料，但還是對於paper
圖的意義不理解
像Fig.1 的圖A
https://i.imgur.com/yXsTY0p.jpeg
Flow的等高線圖越密集應該是代表表現量越高吧，CAR-TRM右上(+,+)和左下(-,-)表現差
不多，這是代表什麼意思？

Fig.6的圖I
https://i.imgur.com/MXm8Yuq.jpeg
這種圖要怎麼看，CAR-TRM在有無CD103的情況下的表現，框框代表什麼，在框框內外是什
麼意思？沒有查到y軸的SSH-H是什麼？

Fig.2的圖A
https://i.imgur.com/lzqAQIa.jpeg
第一次看到PCA圖，查的資料都是這是將資料降維，有三種主成份，但還是不懂點的遠近
跟位置代表什麼意思

Fig.3的圖A和Fig.S4的圖B
https://i.imgur.com/Qa7z1Wr.jpeg
https://i.imgur.com/OxRiPcG.jpeg
也是第一次看到UMAP圖，查到是相似的會聚集在一起？Fig.3這是收集細胞後擴增，利用s
cRNA-seq處理，再進行聚類分析，第一張是可以看出三種標記的表現量比較，點的數量就
代表表現量嗎？第二張圖的紅點較多代表什麼意思，CAR-TRM的擴增較多？第三張完全看
不懂，這是代表細胞主要在哪個階段嗎？是CAR-Tconv還是CAR-TRM，這樣也看不出量多寡
，點的位置有意義嗎？
Fig.S4點的數量是表現量嗎？這樣是MKI67表現較多？還是要對照點分佈的位置一起看？

拜託各位先進幫忙，可能很多笨問題，但真的研究很久還是不懂，謝謝您們！

如果內容太多，留言不太方便，可以站內信，謝謝！

--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 223.137.140.21 (臺灣)
※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1714978024.A.5F8.html
→ memory0907: 個人覺得，如果沒有flow cytometry和scRNAseq的概念，
→ memory0907: 實在很難用文字描述到讓你明白…
→ xxtomnyxx: 大學？碩士？學科背景？有多少相關技術知識？
→ xxtomnyxx: 這些圖都算簡單的了，就算是第一次看也該能理解才對，
→ xxtomnyxx: 現在 Cell 和 Nature 上盡是些奇葩分析的奇葩圖表，那
→ xxtomnyxx: 些真的有夠難理解的。
→ xxtomnyxx: 然後常常在版上看到這類詢問知識還想請人手把手教的文
→ xxtomnyxx: ，對於專業知識被如此廉價的看待感到很無奈
→ xxtomnyxx: 要給建議的話，我會說：你會看不懂是因為你的理解幾乎
→ xxtomnyxx: 都錯了，請搭配文章內文的描述，去推測這張圖要怎麼解
→ xxtomnyxx: 讀會符合文章想表達的意思
→ abeautiii: 已解惑，謝謝
※ 編輯: abeautiii (223.137.140.21 臺灣), 05/07/2024 13:00:55
推 surgeon999: 3F 兇哦