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(手機排版 亂掉抱歉) 各位前輩先進大家好 最近在用western blot跑小分子蛋白(17kda) 但band總是跑出奇怪的形狀,如附圖(非常醜請見諒) https://i.imgur.com/7jeWYfh.jpeg 連internal control (42kda)都出現拖尾的現象,如附圖 https://i.imgur.com/frrTqXF.jpeg 我是使用15% SDS-PAGE 1.5mm 蛋白loading 10到30ug都試過,體積也是試過10ul-30ul 上膠用75v跑到上膠底端,下膠用100v跑到快跳海 Transfer是使用PVDF膜(methanol浸泡1分鐘),100v 90min(塞冰桶,拿出來液體是冰 的) Blocking用5% BSA室溫兩小時,一抗用BSA照data sheet 1:2000稀釋 4度overnight,二 抗也是照data sheet用BSA 1:2000稀釋,室溫兩小時,Blocking跟染抗的每個步驟中間都 用TBST wash三次,每次五分鐘,最後ECL 1:1配好加1ml壓片。 照上述過程都還是有相同的情況,本來懷疑是我製膠的問題,所以有試過用commercial g el也是相同情況,懷疑是transfer的問題所以有試過濕式跟半乾式,但也沒有改變。 麻煩各位先進前輩了!謝謝! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 101.10.5.157 (臺灣) ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1734433015.A.28C.html
maurice9325: 看起來是膠或是蛋白有問題。膠借別人的材料試試看,12/17 20:28
maurice9325: 或是請跑出來正常的人幫你配一片膠。另外蛋白質如果12/17 20:28
maurice9325: 是直接收沒定量或是組織檢體,建議重複冷凍後多煮幾12/17 20:28
maurice9325: 次。12/17 20:28
maurice9325: 阿阿,沒看到已經有用其他膠。那marker漂亮嗎,試試12/17 20:30
maurice9325: 看從蛋白前處理改善看看。因為從fig 2,可以看到跑12/17 20:30
好的感謝
maurice9325: 完膠的結果就很怪了。12/17 20:30
Qaaaa: 看起來像樣品沒純化乾淨 很多時候如gDNA沒去掉 大分子會在12/17 21:20
好的,我再試試DNase跟sonication
Qaaaa: 跑膠時於上方拉扯而變成這種撕咬感12/17 21:21
xxtomnyxx: 42 kDa拖條除了DNA以外,還有可能是下太多蛋白了 12/17 22:03
一開始下10ug的蛋白,但17那條太少了看不到,42還是有拖尾的現象
xxtomnyxx: 你的 transfer buffer 配方是什麼?有加SDS嗎?12/17 22:04
我是直接買bio-rad commercial 的transfer buffer來稀釋,沒有加SDS
xxtomnyxx: 順便問個你用的跑膠系統是哪個廠牌的?12/17 22:07
跑膠、transfer的機器跟buffer都是用bio-rad的 ※ 編輯: soyokenny (123.195.77.180 臺灣), 12/17/2024 23:04:39
darrenyo: Marker如果沒歪樣本歪那就是 樣本前處理的問題吧12/18 13:47
Renina: 跟廠商要pre casting gel試用品跑一次看看,看起來就是膠12/25 13:22
Renina: 的問題12/25 13:22
Renina: glycine有沒有受潮呢 12/25 13:22
Renina: 其他東西有沒有過期或是混到別的液體,濃度有沒有配錯呢 12/25 13:22
jockersung: 已私有可能是鹽類跟dna等等的影響。除了加dnase外,可 12/26 19:15
jockersung: 以用cutting column 去掉10k(或是5k 1k的)以下的跑 12/26 19:15
jockersung: 看看 12/26 19:15
tynse71864: 想問樣品怎麼處理的? 我家也是 biorad commercial全套 12/28 20:54
tynse71864: 但偶爾發現樣品很黏稠 (太濃或有 DNA ) 就可能會這 12/28 20:54
tynse71864: 樣12/28 20:54
nuwoos: 小分子蛋白跑到一半就要停吧。01/03 23:10
※ 編輯: soyokenny (118.169.82.38 臺灣), 02/04/2025 16:29:28