作者gearty (Gearty)
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標題[新聞] 諾貝爾化學獎得主用AI預測蛋白質
時間Thu Oct 10 19:27:55 2024
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諾貝爾化學獎得主用AI預測蛋白質 將成抗體篩選、藥物設計主流
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聯合報/ 記者 李芯/ 台北即時報導
2024年諾貝爾化學獎今日宣布,華盛頓大學的生物化學家貝克(David Baker)、Google
DeepMind的瓊珀(John Jumper)及哈薩比斯(Demis Hassabis),分別以蛋白質設計與
蛋白質結構研究,拿下本屆化學獎殊榮。學者指出,貝克的實驗室所開發的軟體,曾開發
出全球第一個人工合成的酵素;瓊珀、哈薩比斯的研究,則藉由AI,在5年內將蛋白質折
疊預測的準確率從40%提高到90%。
台灣科技媒體中心在諾貝爾化學獎得主出爐後,邀請國內學者分析得主研究成果。中央研
究院生物化學研究所副研究員吳昆峯說明,貝克的實驗室所做的研究,是蛋白質折疊的研
究領域中非常困難的題目,科學家50幾年來用盡一切的方法預測,想讓蛋白質折疊成正確
的構形。貝克的實驗室擁有全世界最領先的技術,他過去發展一套稱為Rosetta的軟體,
不只能修改原來的蛋白質,也可以從不存在的序列找到新的功能、新的摺疊方式。
吳昆峯指出,Rosetta在2003年就開發出全球第一個人工合成、人工設計的酵素,這證明
可以用軟體來設計一個「不存在於世界上任何一種序列」的蛋白質,並引發學界20年來相
繼投入這個領域。往後Rosetta軟體持續優化、修改後,才會有AI軟體的加入,讓蛋白質
結構預測更成功。
中央研究院生物化學研究所研究員徐尚德指出,Rosetta最近還推出了非常強大的功能,
名為Rosetta Diffusion,跳脫過去用基因得到蛋白質結構、了解功能,用已知的知識創
造未知的東西的方式,能夠用「生成」的方法來設計蛋白質,並辨識蛋白質能不能製成藥
物。疫情期間貝克的公司還直接上市,並由另一個大藥廠用10億美金買下,也顯示當今生
技產業的潛力。
國立清華大學化學系助理教授楊自雄表示,哈薩比斯及瓊珀研究的重要性在於,只要給出
一串基因序列,就能生成出應該得到的靜態蛋白質結構。過去科學家用物理方式做蛋白質
折疊,準確率相對低又耗時長,2016年的準確率僅約40%。而到2020年,兩人提出的
AlphaFold2模型準確率達到90%,也就是說,給出一段DNA序列,折疊出來的蛋白質結構
有90%可以跟實質上得到的結構一樣,是對於藥物設計非常重要的發現。
吳昆峯指出,他們設計的東西可能還沒有到藥物開發、上市階段,但往後幾年應該會成為
做抗體篩選、藥物設計的主流方式。
徐尚德表示,貝克在疫情之後不太出遠門,去年台灣生物物理學會有邀請貝克演講,但他
表示無法到台灣,只能用錄影的方式。徐也聽過貝克的幾次演講,最近一次是在西雅圖大
學辦理的研討會,據他了解,貝克現在的實驗室有一整棟4層樓,一半做實驗、一半做AI
。即使已經不在研究的第一線,他每天都還是有不同的想法、和不同人討論,仍充滿好奇
心,讓他直呼非常了不起。
https://uc.udn.com.tw/photo/2024/10/09/realtime/30688655.jpg
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→ Forcast: 欸挨得獎 114.25.151.59 10/10 19:29
推 higameboy: 這劇情我知道 惡靈古堡、移動迷宮 42.73.234.75 10/10 19:30
→ t00012: 台灣學術界:用AI就是作弊 49.217.124.160 10/10 19:43
推 Yahweh: 標題下的真爛 最爛的弱點就是抗體抗原交互118.165.138.250 10/10 19:47
→ NKTcell: 歡迎他們貢獻腦袋做AI啊 相信將來可以變1 106.64.177.241 10/10 19:47
→ NKTcell: 00%預測 106.64.177.241 10/10 19:48
→ Yahweh: 作用的預測,protein-ligand interaction118.165.138.250 10/10 19:48
→ Yahweh: 的預測,還成主流 慢慢等吧118.165.138.250 10/10 19:48
→ Yahweh: 可準確預測的都是和資料庫存在的相似序列118.165.138.250 10/10 19:50
→ Yahweh: 沒有相似序列的孤兒序列預測結果根本科科118.165.138.250 10/10 19:51
推 hygen: 新藥要大爆發了 39.9.72.89 10/10 19:52
→ Yahweh: 人類對於 structure-activity, structure-118.165.138.250 10/10 20:00
→ Yahweh: function 的關係根本幾近無知,你跟我說ai118.165.138.250 10/10 20:01
→ Yahweh: 要去跟誰學? 更別提預測118.165.138.250 10/10 20:01
推 AB7R: 應該要把獎項給AI才對 133.175.215.23 10/10 20:02
推 kamisanma: 什麼時候要新增諾貝爾AI獎 61.223.202.221 10/10 20:12
→ kamisanma: 不過39歲得獎…好猛喔 61.223.202.221 10/10 20:13
→ NKTcell: 無知不等於不會思考不會推理跟想像阿 36.228.195.158 10/10 20:25
推 ladygaga168: Go Dawgs! 114.45.146.230 10/10 20:27
→ NKTcell: AI並不是只有在學正解 36.228.195.158 10/10 20:30
→ NKTcell: 眾人的推測思考模式 得到90%準確度 36.228.195.158 10/10 20:32
→ NKTcell: 再加個諾貝爾獎得主的腦袋 一定可以100% 36.228.195.158 10/10 20:33
→ NKTcell: 生成式AI的頂點就是SIRI 問題是 36.228.195.158 10/10 20:34
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推 d12345631: AI. 開藥 1.175.217.192 10/10 20:45
→ ariesd: 後兩個是用AI幫忙第一位做研究吧 59.126.203.226 10/10 20:48
推 al311166: 嗯 看起來可以取得醫生了114.137.221.151 10/15 09:59
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