[問題] 使用LC/MS或GC/MS測量小分子量蛋白質濃度

[winexchiu (羽人非獍)]

如果有一個目標蛋白序列已知，由68個胺基酸組成，無任何後轉譯修飾

在約40%左右粗萃蛋白質樣品中約含0.1%~1%

如果要測量目標蛋白質在粗萃樣品中的濃度，大家會推薦使用LC/MS或GC/MS呢?


需要事先取得該目標蛋白的標準品嗎? 或不用標準品也能測?

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推 tommy770726: 要先預測trypsin digestion完在LCMS最abundant的pept
→ tommy770726: ide一兩個 然後買合成的peptide standard做定量
→ Barolo: 68個胺基酸很難氣化吧 無法氣化的東西是無法GC的
→ winexchiu: 68個胺基酸標準品會很難合成嗎?
→ ChesterYeah: 你定量就樣先把標準品tune好
→ ChesterYeah: 然後在基質環境下去拉標曲線
→ ChesterYeah: 不然就要同位素或其他方法