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代po如題 自從大三偶爾碰到Liquid phase AFM之後就對物理方法來研究生化系統很有興趣,目前主 要最喜歡單分子生物物理和X ray結晶學 也修了些生化相關的課像:有機,生化,蛋白質結構,蛋白組學,分子生物,生物資訊等等來副 修 反而是物理修很少,選修只有光學,碩班統力,固態,雷射跟計算物理而已 研究所的話目前首要目標是Max Planck biophysics,ETH,EPFL,TUM,Eindinburg,Gottinge n,Heidelberg,NUS,NTU,UTokyo, 台大也很喜歡,只是化學所跟生化所似乎口味對的不多,大概也只有~3個 請問有類似經驗的大大有心得嗎?非常感謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 202.155.194.46 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Physics/M.1508313111.A.E91.html ※ 編輯: BrowningZen (202.155.194.46), 10/18/2017 15:52:48 ※ 編輯: BrowningZen (202.155.194.46), 10/18/2017 15:53:52
wohtp: Biophysics現在是超級顯學,你根本不必從物理走出去也可以 10/18 16:02
wohtp: 做你想做的東西啊 10/18 16:02
wohtp: 雖然你多半不能借鏡,有興趣的話你可以查查Ben Simons現在 10/18 16:05
wohtp: 都幹什麼去了,就Atland & Simons的作者,當年是我很喜歡的 10/18 16:06
wohtp: 教授 10/18 16:06
wohtp: 喵的我也想跳過去做生物算了 XD 10/18 16:07
BrowningZen: 謝謝w大意見,不過似乎留在物理界玩生物的人大多都是 10/18 16:19
BrowningZen: 做光學/建模? 10/18 16:19
KBmax: 那作Biosystem的transfer phenomena理論的呢?像是excitati 10/18 17:32
KBmax: on energy transfer 跟 charge transfer 10/18 17:32
sukeda: Charge transfer或exciton transfer大部分都不是物理學家 10/18 18:37
sukeda: 在做QQ 10/18 18:37
KBmax: 理論化學家的天下 ^^ 10/18 21:47
KBmax: 不過我看這方面發在JCP上面的也蠻多從物理系發的欸@@ 10/18 21:47
Eriri: 美國這麼多物理系的人做生物物理...各式各樣的都有 哪有你 10/19 00:35
Eriri: 說的都是做光學或建模 10/19 00:35
caseypie: 你的興趣基本上就是structural biology中有點退燒的那片 10/19 06:50
caseypie: 現在流行的是FRET和Cryo-EM,還有謎一般的NMR 10/19 06:50
caseypie: 喔,所謂NMR的謎是它也不算流行了,但也很難真的不流行 10/19 06:51
caseypie: X-ray其實也是這樣啦,不管怎樣都需要有人長晶體 10/19 06:51
caseypie: 但也不太可能再紅起來了 10/19 06:52
caseypie: 回到標題的問題:我和我現在的老闆都是理論物理PhD 10/19 06:54
caseypie: 但是現在在醫學院生化所工作.... 10/19 06:54
abac1230: +1 同為搶生化飯碗的物理人 :) 10/19 15:10
bluecadence: 看看protein databank滿滿的蛋白質結構,就別做X-ray 10/21 10:12
bluecadence: crystallography了吧 :p 。比較起來 Single Molecule 10/21 10:13
bluecadence: 還比較有趣。這個時代 sequence (Genome database) 10/21 10:15
bluecadence: 資訊爆炸,structure (PDB)資訊爆炸,但是對於 10/21 10:16
bluecadence: sequence - structure - function 的了解還是非常有 10/21 10:17
bluecadence: 現。如果是我,我大概比較想走 Dynamics (structure 10/21 10:17
bluecadence: in motion, structure as a function of time),來 10/21 10:18
bluecadence: 填補 sequence - structure - [dynamics] - function 10/21 10:18
bluecadence: 的空缺。不然就是走生物資訊,從一堆爆炸的資訊中找 10/21 10:19
bluecadence: 出與生物功能的連節。Function follows form,做生物 10/21 10:20
bluecadence: 的產生一堆function 的資訊,做篇生物物理化學的人產 10/21 10:21
bluecadence: 生一堆form的資訊,然後中間這個連結連部起來 :p 10/21 10:21
bluecadence: 連"不"起來 錯字 10/21 10:23
bluecadence: 非常有"限"; 做"偏"生物物理 錯字。 抱歉錯字很多 10/21 10:43
caseypie: 動態資訊就是FRET會紅NMR還有人要以及CryoEM興盛的原因 10/21 10:54
caseypie: 生物資訊也是現在的顯學,不過灌水越來越困難了 10/21 10:54
caseypie: 其實還有兩個方向是台灣似乎幾乎還沒有人留意到的 10/21 10:55
caseypie: 一個是無結構蛋白,另一個是無膜液狀胞器 10/21 10:56
caseypie: 這兩個方向其實又是被細胞內基因調控的研究帶起來的 10/21 10:57
caseypie: 我就不知道台灣生物物理有沒有在碰後轉錄後轉譯的題材了 10/21 10:58
bluecadence: 無結構蛋白很困難因為 1. 無法結晶不能用 x-ray 2.在 10/21 11:00
bluecadence: 溶液中無平均結構,任何光譜方法都會造成非常寬的頻 10/21 11:02
bluecadence: 寬。所以玩 binding induced structure 應該蠻好玩的 10/21 11:03
bluecadence: 這東西很多可以討論 結構/entropy etc.. 不過台灣沒 10/21 11:04
bluecadence: 人玩,連審計畫的人都看不懂 XD 10/21 11:05
bluecadence: 例如你如果寫個想探討 entropy 項對於 binding 的 10/21 11:14
bluecadence: free energy 的貢獻,和對 binding specificity 的影 10/21 11:15
bluecadence: 響,就已經沒人可以審了 :p 10/21 11:16
caseypie: 這個在北美其實正流行,entropy的影響一直都有人在做啊 10/21 11:18
caseypie: 並沒有像疏水性驅動蛋白質折疊那麼老梗,但也不是沒聽過 10/21 11:19
bluecadence: 在國外是老梗,在台灣沒人玩 10/21 11:20
caseypie: 現在玩結構都玩動態玩結構係縱而不是看單一靜態結構 10/21 11:20
caseypie: 也就是說北美在流行的都是你說的「很難」的東西啊.... 10/21 11:21
bluecadence: 所以我說要玩就玩dynamics :p 10/21 11:21
caseypie: 我不知道這方面台灣的差距到了這麼大... 10/21 11:21
bluecadence: 台灣的資源,與資源分配狀況,這會很難理解嗎? 10/21 11:29
bluecadence: 還有NMR有甚麼好謎的?一個完全能被半古典量子理論預 10/21 11:32
bluecadence: 測的機器,再簡單不過了 10/21 11:32
bluecadence: FRET, EPR spin label實驗也都是N年前的老梗不是嗎? 10/21 11:35
caseypie: 我說啦,我說的謎是指他不怎麼流行卻又永遠還能有新花樣 10/21 11:35
caseypie: 我也解釋了,要不是最近動態研究流行起來,NMR早就死透 10/21 11:36
bluecadence: CryoEM 也不過最近得了獎 其實也是老梗了 10/21 11:36
caseypie: 這些技術的原理在生物物理裡從來不是重點啊 10/21 11:37
caseypie: 技術是否老梗的關鍵在於工程上精度能否增強以及新的應用 10/21 11:37
bluecadence: 的確不是重點 "很難" 一直是生物系統很難 有甚麼問題 10/21 11:38
bluecadence: 嗎? 10/21 11:38
bluecadence: structure-funtion relationship 你覺得很簡單嗎? 10/21 11:38
caseypie: 上次看到有人做了Nuclear Pore Complex的CryoEM,蠻強的 10/21 11:39
bluecadence: 搞了一堆序列結構動態與功能的連結又知道了多少? 10/21 11:40
caseypie: 所以實驗上的難度在工程方面精度和分子大小的強化 10/21 11:42
caseypie: 還有新的可探測系統的開發 10/21 11:43
caseypie: 理論模擬上則是進行動態係縱結構還有生化反應網絡的討論 10/21 11:44
caseypie: 靜態->動態、單一結構->結構係綜、單分子->分子互動 10/21 11:45
caseypie: 乃至於介觀complex/consensate/granule的討論 10/21 11:46
bluecadence: 你繼續幫原po上課吧 他會感激你的 :p 10/21 11:47
caseypie: 同時用統計大數據手段去「先求結果再求原理」 10/21 11:47
caseypie: 這些都是現在(歐美)熱門的研究方向啊 10/21 11:48
caseypie: 我就在說你說的方向沒錯順便補充點東西,也沒要幫誰上課 10/21 11:52
caseypie: 多談一點讓圈外人少點誤解,也許多拉一些台灣人入坑 10/21 11:54
caseypie: 說什麼上課呢 10/21 11:54
BrowningZen: 哇上面各位大大真的解釋得很詳細,真的感激不盡 10/22 18:16
BrowningZen: 既然有人說x-ray不流行,也確定想走偏實驗的結構/單 10/22 18:23
BrowningZen: 分子,所以台灣的話目前我找了台大化學系一個有在做 10/22 18:23
BrowningZen: 單分子生物物理的教授.德國也好像有不錯的cryoEM組, 10/22 18:24
BrowningZen: 未來也會去信問一下 10/22 18:24
BrowningZen: 不過感覺做結構就算是做實驗的,電腦能力還是要很不 10/22 18:28
BrowningZen: 錯?請問有什麼特別要先學的嗎? 10/22 18:28
bluecadence: 如果有時間玩玩 linux 吧。然後有再多的時間學個 10/23 23:06
bluecadence: scripting language 像是 python。有再多的時間學一 10/23 23:06
bluecadence: 下 C 。有更多的時間學一下 C++ 。 10/23 23:07
bluecadence: 這樣大概差不多了,再遇到甚麼電腦語言看一下語法就 10/23 23:09
bluecadence: 就立刻能上手了 10/23 23:09
bluecadence: 不過老實說 這些東西都是其次 實驗做的好做的出來 才 10/23 23:14
bluecadence: 是最重要的 其他的東西 有空無聊再玩吧 10/23 23:15
ricoricoyan: 來台大化學 你會後悔…去國外吧……… 10/26 11:26
sputtering: python顯學耶 正在熟悉語法中 之後想做量子編程 10/27 10:43