[問題] .txt的資料匯入及行列轉換

[milkdad (milkdad)]

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[問題類型]:

程式諮詢(我想用R 做某件事情，但是我不知道要怎麼用R 寫出來)


[軟體熟悉度]:

新手(沒寫過程式，R 是我的第一次)

[問題敘述]:
想匯入一個約100mb的.txt檔
此檔案的“列”只有12筆 但“行”有約92萬筆
因此想要做行列轉換 以利後續分析

但天真如我卻發現連匯入資料都成問題



[程式範例]:

我是想直接用read.table的方式匯入 再用 t()來轉置 如下
datfile=paste(路徑, '檔案.txt', sep='')
data=read.table(datfile, header=TRUE,sep='\t')

但到了這一步 R就一直轉了兩個小時 因此還沒試到行列轉換

才想上來詢問 麻煩各位大大幫忙




[環境敘述]:

作業系統：OSX 10.9.5
R版本：3.1.3


[關鍵字]:


資料匯入 行列轉換


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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.112.117.61
※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/R_Language/M.1441086807.A.EB3.html
推 Edster: 不至於這麼慢吧，我常常在讀500~600Mb的檔案，幾秒就結束
→ Edster: 大資料可以翻閱20150721 C大發的那幾篇文.
→ Edster: 或是試試readr::read_table, 作者也是dplyr的作者.
→ Edster: 這個package下的讀檔案非常快. 上禮拜才讀過5G的檔.
→ milkdad: 好的 我試試看！感謝回覆 我一開始也覺得不會這麼慢才對
→ celestialgod: 瓶頸應該在column class checking...
→ celestialgod: 建議全部設定成character，讀進來再依照自己需求做
→ celestialgod: 轉換
推 celestialgod: 我說的column class可以在read.table的colClasses
推 celestialgod: 選項設定
→ celestialgod: 我自己測試之後，還是直接讀比較好
→ celestialgod: 轉換成本太高
→ celestialgod: 除非確定你要直接橫轉直，每一個ROW的元素都同樣類
→ celestialgod: 型