Re: [問題] 安裝 OpenMP 與套件 stringi

[MiddleRe (中間綠)]

回應一下自己的文章

我最後用這篇：


https://stackoverflow.com/questions/68263165/installing-r-on-osx-big-sur-edit-and-apple-m1-for-use-with-rcpp-and-openmp

最後一個回答解決此問題


這篇的方法是立基於 R 4.1 的 ARM 版和 ARM 64 處理器的蘋果電腦

如果安裝了 R 4.1，R Studio 也要使用 preview 版本的

（目前是 R Studio 1.4.1725）

否則連 R Studio 都無法開啟

下載完預覽版的 R Studio 以後

第一步是去應用程式商店安裝 Xcode

（也可以用命令：sudo xcode-select --install）

第二步是在終端機使用以下兩個命令：

curl -O https://mac.r-project.org/openmp/openmp-11.0.1-darwin20-Release.tar.gz
sudo tar fvx openmp-11.0.1-darwin20-Release.tar.gz -C /

但奇怪的是，我在解壓縮這個檔案是會出現奇怪的錯誤

這點可以見原文

我的解決方法是用內置的解壓縮軟體解壓縮這個檔案

然後會得到一個資料夾 usr，裡面還有一個資料夾 local

local 裡頭還有兩個資料夾：lib、include

到 finder，進到 /usr/local 中

分別把剛剛解壓縮的 lib 與 include 兩個資料夾裡的東西

丟到相應的資料夾去

第三步是在終端機使用 GNU Nano 創建 Makevars 檔，輸入：

cd ~
mkdir .R
nano Makevars

然後貼上以下的指令：

CPPFLAGS += -Xclang -fopenmp
LDFLAGS += -lomp

接著按下鍵盤 Control + O

再按下 Enter

最後按下 Control + X 離開畫面

第四步就是要安裝 gfortran

到 https://github.com/fxcoudert/gfortran-for-macOS/releases 去

可以找到兩個檔案，分別是

1. gfortran-ARM-11.0-BigSur.pkg

2. gfortran-ARM-11.0-BigSur.tar.xz

前者是有圖形化介面的安裝檔，後者就要自己解壓縮

但前者會安裝錯位置

因為 R 4.1 裝 ARM 版的話，R 是會去讀 /opt/R/arm64/ 底下的檔案

所以應該要把 gfortran 裝到 /opt/R/arm64/ 底下才對

因此選擇以 gfortran-ARM-11.0-BigSur.tar.xz 的方式來安裝 gfortran

同樣地，可以使用終端機命令：

cd /opt/R/arm64/
sudo mkdir gfortran
sudo tar -xzyf gfortran-ARM-11.0-BigSur.tar.xz -C /opt/R/arm64/

但此時我的電腦會報錯：tar: Can't specify both -y and -z

我的解方還是如同上面的作法，即手動解壓縮

會得到一個 gfortran 資料夾

把它丟進 /opt/R/arm64/  就對了


最後一步就是清乾淨原本的 data.table

然後在 Console 輸入：

remove.packages("data.table")
install.packages("data.table", type = "source",
    repos = "https://Rdatatable.gitlab.io/data.table")

之後使用 data.table 會顯示：

> library("data.table")
data.table 1.14.1 IN DEVELOPMENT built 2021-07-16 21:14:20 UTC; root using 4
threads (see ?getDTthreads).  Latest news: r-datatable.com

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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 49.217.197.68 (臺灣)
※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/R_Language/M.1626724798.A.3C7.html
※ 編輯: MiddleRe (49.217.197.68 臺灣), 07/20/2021 05:33:38
推 khaos: 有分享  推一個
推 cywhale: 推 沒有這樣的環境實在沒法試，可供以後的網友參考經驗
→ andrew43: 看來這改平台的陣痛期還要持繼一陣子。這些毛對使用者
→ andrew43: 實在不友善。
→ andrew43: 有pkg可裝但竟然是「陷阱」而要自己編...
推 joe120519: 感謝勇者分享
推 DrRd: 感恩分享，不然我之前都用單核跑XD
推 DrRd: 試了還是失敗，繼續用單核跑…
→ MiddleRe: QQ 那我也不知道為何我可以了