[問題] 卡方檢定的使用

[freeinmusic (蛤)]

本身是統計新手

最近遇到實驗結果需要分析其差異性

但不確定是否是用卡方檢定

所以上來請教一下

以下是實驗敘述及數據:


某組織是由A,B 兩種細胞組成的

我們想知道加藥是否能改變某個組織的細胞組成

因此我們對實驗動物加藥/沒加藥後取組織出來計算A,B兩種細胞百分比，

三重覆後得到數據如下:

第1次實驗取出的組織

沒加藥: A細胞 70% B細胞 30%

有加藥: A細胞 40% B細胞 60%

第2次實驗取出的組織

沒加藥: A細胞 72% B細胞 28%

有加藥: A細胞 35% B細胞 65%

第3次實驗取出的組織

沒加藥: A細胞 66% B細胞 34%

有加藥: A細胞 43% B細胞 57%


我目前的做法是將三次結果平均後得到

沒加藥: A細胞 69.3% B細胞 30.6%

有加藥: A細胞 39.3% B細胞 60.6%

再來用卡分檢定計算


但因為我目前看到使用卡方檢定的例子裡

每一個樣本在各類別變項中都是獨立的

而我的數據裡是一個組織在細胞的類別變相裡分別占不同的百分比

然後又有三重覆

因此想詢問一下版上的大大們，這種情況是否可以用卡方檢定計算呢?

或者是只能用student t-test比較沒加藥和有加藥時A細胞的p值及B細胞的p值呢?

感謝~

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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.109.32.9 (臺灣)
※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Statistics/M.1634742465.A.4F9.html
→ andrew43: 考慮CMH test，第幾次實驗視為分層。
推 mathchin: 這邊看起來觀察值是組織裡A,B的比例（連續變數），用t-t
→ mathchin: est應該可以但n=3好像有點小，卡方一般用在類別變數？
推 andrew43: 看看是不是真的算出細胞個數還是只有百分比。
感謝樓上的大大們!!

我沒有注意到我的資料的變數是連續變數，看起來我應該用ttest比較正確~

然後n值其實不只3 但怕資料太多打起來太亂所以只列了三個

因為我們的組織個體差異蠻大的，所以如果算細胞個數的話差異會非常大，因此

才會用百分比的方式，不過我會再研究一下CMH test，再次感謝~~
※ 編輯: freeinmusic (140.109.32.9 臺灣), 10/22/2021 18:55:49
推 andrew43: 考慮採用配對樣本檢驗。
推 zhiying: 如果加藥前後是同一隻動物的同一個組織，要用配對樣本
→ zhiying: t檢定，如果是不同隻動物的組織用ttest就好，還要考慮
→ zhiying: 如果每個組織細胞數差很多n又小可能不是常態分佈，要用
→ zhiying: Mann–Whitney U test (獨立）或是Wilcoxon signed-ra
→ zhiying: nk test （配對）
→ recorriendo: combined test除了用CMH也可以用Liptak method
→ recorriendo: 或Fisher method